RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533811.1

PACS1-214, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-214ENST00000533811 SHFQ7M4L6 423 aa7.37□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 C16orf82Q7Z2V1 217 aa7.37□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 ZNF329Q86UD4 541 aa7.37□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 CALHM1Q8IU99 346 aa7.37□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 ZNF676Q8N7Q3 588 aa7.37□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 POC1AQ8NBT0 407 aa7.37□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 OR11H6Q8NGC7 330 aa7.37□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 THEM6Q8WUY1 208 aa7.37□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 OR8B4Q96RC9 309 aa7.37□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 C9orf16Q9BUW7 83 aa7.37□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 Q9H521 79 aa7.37□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 REEP1Q9H902 201 aa7.37□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 PALMDQ9NP74 551 aa7.37□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 DNAJB9Q9UBS3 223 aa7.37□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa7.37□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa7.37□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa7.36□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 PSMB11A5LHX3 300 aa7.36□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 OR5B21A6NL26 309 aa7.36□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 RIIAD1A6NNX1 92 aa7.36□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 TNFRSF11BO00300 401 aa7.36□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 ZFPL1O95159 310 aa7.36□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 SOX14O95416 240 aa7.36□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 LYNP07948 512 aa7.36□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 PGA5P0DJD9 388 aa7.36□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 ZNF3P17036 446 aa7.36□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 HAAOP46952 286 aa7.36□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 BLVRAP53004 296 aa7.36□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 IL18R1Q13478 541 aa7.36□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 ATP6AP1Q15904 470 aa7.36□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 LINC01590Q5TEZ4 76 aa7.36□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 GDPD3Q7L5L3 318 aa7.36□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa7.36□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 Q8NFD4 153 aa7.36□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 OR5A2Q8NGI9 324 aa7.36□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 OR4Q3Q8NH05 313 aa7.36□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 DNAJC9Q8WXX5 260 aa7.36□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 EME1Q96AY2 570 aa7.36□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 ZNF714Q96N38 554 aa7.36□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 RDH12Q96NR8 316 aa7.36□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 DUX3Q96PT4 197 aa7.36□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 CLEC7AQ9BXN2 247 aa7.36□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa7.36□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 NIPAL2Q9H841 368 aa7.36□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 LIN7BQ9HAP6 207 aa7.36□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 LRRC42Q9Y546 428 aa7.36□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 STAB2Q8WWQ8 2551 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 FAM183AA6NL82 134 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 FAM90A22PA8MWA6 464 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 J3QT63 122 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 SELENOFO60613 162 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 RAMP3O60896 148 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 E2F6O75461 281 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 INMTO95050 263 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 RBP4P02753 201 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 LYL1P12980 280 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 HTR1DP28221 377 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 BRS3P32247 399 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 ECI1P42126 302 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 LUMP51884 338 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 ARHGDIBP52566 201 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 ESRRGP62508 458 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 SNAPC1Q16533 368 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 ZNF684Q5T5D7 378 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 OR2W3Q7Z3T1 314 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 OSR2Q8N2R0 312 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 TPRX1Q8N7U7 411 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 NRBF2Q96F24 287 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 OR51V1Q9H2C8 321 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 GPR173Q9NS66 373 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 IL20Q9NYY1 176 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 SLC22A13Q9Y226 551 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 PIGLQ9Y2B2 252 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 SESN1Q9Y6P5 492 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 LCE6AA0A183 80 aa7.34□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 FAM172BPA6NC97 362 aa7.34□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 K7N7A8 449 aa7.34□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 PSMD9O00233 223 aa7.34□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 OR2F2O95006 317 aa7.34□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 CCNB2O95067 398 aa7.34□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 LY86O95711 162 aa7.34□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 NRASP01111 189 aa7.34□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 MYCNOSP40205 109 aa7.34□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa7.34□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 MICAQ29983 383 aa7.34□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.34□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa7.34□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 KRT77Q7Z794 578 aa7.34□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 AMIGO2Q86SJ2 522 aa7.34□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa7.34□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 ZNF573Q86YE8 665 aa7.34□□□□□ -1.23
PACS1-214ENST00000533811 IQCF1Q8N6M8 205 aa7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 151.1 ms