RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524356.1

PCM1-223, Transcript of pericentriolar material 1, human

TSL 2

Gene PCM1, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCM1-223	ENST00000524356	HORMAD1	Q86X24	394 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	CA13	Q8N1Q1	262 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	STPG2	Q8N412	459 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	SFXN5	Q8TD22	340 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	DOK4	Q8TEW6	326 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF488	Q96MN9	340 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	HBEGF	Q99075	208 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356		U3KQA8	63 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	HIVEP1	P15822	2718 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	RP1	P56715	2156 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	OR2AT4	A6NND4	320 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	TMEM238	C9JI98	176 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356		E9PLD3	99 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356		F6UB75	175 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356		H3BNH8	94 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356		J3QLI3	93 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356		K7EM74	188 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	GABRP	O00591	440 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	NME4	O00746	187 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	ACOX3	O15254	700 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	TGOLN2	O43493	480 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	RAD51C	O43502	376 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	MPZL2	O60487	215 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	SNAP29	O95721	258 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	RAB36	O95755	333 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	ARG1	P05089	322 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	OR8U9	P0C7N5	309 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	PAX1	P15863	534 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	CMA1	P23946	247 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	GNRHR	P30968	328 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	RAB7A	P51149	207 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	CAV2	P51636	162 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	GPM6A	P51674	278 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	AQP5	P55064	265 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	ERVK-16	P61578	105 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	RHOA	P61586	193 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	KIR2DS1	Q14954	304 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	SPCS2	Q15005	226 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	GUSBP1	Q15486	140 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	GUK1	Q16774	197 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	PARP15	Q460N3	678 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	CCDC153	Q494R4	210 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	GID4	Q8IVV7	300 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	OR8U1	Q8NH10	309 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	FAM222B	Q8WU58	562 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	FBXO17	Q96EF6	278 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	C9orf85	Q96MD7	179 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	STAC	Q99469	402 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	RNF126	Q9BV68	326 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	FAM107B	Q9H098	131 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	DSN1	Q9H410	356 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	RDH14	Q9HBH5	336 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	IL17C	Q9P0M4	197 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87

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