RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521332.5

PTK2-231, Transcript of protein tyrosine kinase 2, human

TSL 4

Gene PTK2, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTK2-231	ENST00000521332	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTK2-231	ENST00000521332	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTK2-231	ENST00000521332	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTK2-231	ENST00000521332	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTK2-231	ENST00000521332	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
PTK2-231	ENST00000521332	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	DLGAP1	O14490	977 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	ZNF737	O75373	536 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	IGLV3-1	P01715	115 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	HMGN1	P05114	100 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	BRS3	P32247	399 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	TCF23	Q7RTU1	214 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	RNF144B	Q7Z419	303 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	CHST6	Q9GZX3	395 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	NDE1	Q9NXR1	346 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	ZNF254	O75437	659 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	TTR	P02766	147 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	GABRR1	P24046	479 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	MPZ	P25189	248 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	ARHGDIB	P52566	201 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	ERVK11-1	P61568	191 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	IL24	Q13007	206 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	GRK1	Q15835	563 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	SLAMF9	Q96A28	289 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	SNX22	Q96L94	193 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	CEP19	Q96LK0	163 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	PKIB	Q9C010	78 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	FAM172BP	A6NC97	362 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	PRR32	B1ATL7	298 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332		F8VVB4	439 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332		F8VWA3	439 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	SLC2A5	P22732	501 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	PEX2	P28328	305 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	SPATS1	Q496A3	300 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	DHFR2	Q86XF0	187 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	TEX12	Q9BXU0	123 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	DPM3	Q9P2X0	92 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	COPS3	Q9UNS2	423 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332		V9GYS6	101 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	TMEM82	A0PJX8	343 aa		14.61	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	NUDT19	A8MXV4	375 aa		14.61	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332		H3BSH0	61 aa		14.61	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	GNGT2	O14610	69 aa		14.61	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	CST1	P01037	141 aa		14.61	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	IGHA1	P01876	353 aa		14.61	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	ROM1	Q03395	351 aa		14.61	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		14.61	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		14.61	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	TMEM42	Q69YG0	159 aa		14.61	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		14.61	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		14.61	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		14.61	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		14.61	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		14.61	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		14.61	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		14.61	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332		U3KQK5	164 aa		14.61	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	PSMB11	A5LHX3	300 aa		14.6	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	MMP23A	O75900	390 aa		14.6	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	OR2F2	O95006	317 aa		14.6	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	HAND1	O96004	215 aa		14.6	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	14.6	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	SNAPC1	Q16533	368 aa		14.6	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	ODF4	Q2M2E3	257 aa		14.6	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		14.6	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		14.6	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		14.6	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	ZNF329	Q86UD4	541 aa		14.6	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	OSR2	Q8N2R0	312 aa		14.6	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		14.6	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	TFAP2C	Q92754	450 aa		14.6	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	APOL4	Q9BPW4	351 aa		14.6	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		14.6	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		14.6	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	LEUTX	A8MZ59	168 aa		14.59	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	OSM	P13725	252 aa		14.59	□□□□□ -0.07
PTK2-231	ENST00000521332	LMO1	P25800	156 aa		14.59	□□□□□ -0.07

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