RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512813.5

CLCN3-208, Transcript of chloride voltage-gated channel 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLCN3, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3-208ENST00000512813 SLC36A3Q495N2 470 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 HEPN1Q6WQI6 88 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 OAFQ86UD1 273 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 OR8H3Q8N146 312 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 OR4C15Q8NGM1 316 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 SGK3Q96BR1 496 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 ZBTB9Q96C00 473 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 TSSK2Q96PF2 358 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 TSPYL1Q9H0U9 437 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 OR14J1Q9UGF5 321 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 SLC22A13Q9Y226 551 aa7□□□□□ -1.29
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CLCN3-208ENST00000512813 A0A1B0GX30 115 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 IGLL5B9A064 214 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 TBX1O43435 398 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 SOX6P35712 828 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 OR1E2P47887 323 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 NPBWR2P48146 333 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 TAS2R41P59536 307 aa6.99□□□□□ -1.29
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CLCN3-208ENST00000512813 RAB40BQ12829 278 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 GALEQ14376 348 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 EDDM3AQ14507 147 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 Q6ZR54 194 aa6.99□□□□□ -1.29
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CLCN3-208ENST00000512813 Q6ZWC4 215 aa6.99□□□□□ -1.29
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CLCN3-208ENST00000512813 C4orf33Q8N1A6 199 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 OR13C2Q8NGS9 318 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 ZNF503Q96F45 646 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 ZNF488Q96MN9 340 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 RASL11BQ9BPW5 248 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 FN3KQ9H479 309 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 OR6C3Q9NZP0 311 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 FBXL17Q9UF56 701 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 SIGLEC7Q9Y286 467 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 G3V318 75 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 TYROBPO43914 113 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 NXPH2O95156 264 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 CDK2P24941 298 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 ACKR3P25106 362 aa6.98□□□□□ -1.29
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CLCN3-208ENST00000512813 Q5VSD8 79 aa6.98□□□□□ -1.29
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CLCN3-208ENST00000512813 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 GTF2H4Q92759 462 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 KCNJ15Q99712 375 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 COPS4Q9BT78 406 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 HES4Q9HCC6 221 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 RIMS3Q9UJD0 308 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 FAT1Q14517 4588 aa6.98□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 EFCAB9A8MZ26 197 aa6.97□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 ZNF732B4DXR9 585 aa6.97□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 M0QX08 132 aa6.97□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 SOCS2O14508 198 aa6.97□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
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CLCN3-208ENST00000512813 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa6.97□□□□□ -1.29
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CLCN3-208ENST00000512813 MSRB3Q8IXL7 192 aa6.97□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 TIGD4Q8IY51 512 aa6.97□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 ZNF781Q8N8C0 355 aa6.97□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 PIGCQ92535 297 aa6.97□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa6.97□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 S1PR3Q99500 378 aa6.97□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 FMO2Q99518 471 aa6.97□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 VIPAS39Q9H9C1 493 aa6.97□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 SLC25A19Q9HC21 320 aa6.97□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 PLSCR3Q9NRY6 295 aa6.97□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 B9D1Q9UPM9 204 aa6.97□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.97□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 GMEB1Q9Y692 573 aa6.97□□□□□ -1.29
CLCN3-208ENST00000512813 OR5B21A6NL26 309 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-208ENST00000512813 ZNF785A8K8V0 405 aa6.96□□□□□ -1.3
CLCN3-208ENST00000512813 ZP3P21754 424 aa6.96□□□□□ -1.3
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