RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM90A15PP0C7V4 464 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM90A13PP0C7W8 464 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM90A14PP0C7W9 464 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM90A24PP0C7X0 464 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 CBR1P16152 277 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 COX5AP20674 150 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 DTYMKP23919 212 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 TGFBR3Q03167 851 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 PPP1R1AQ13522 171 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 GRK1Q15835 563 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 NHLRC3Q5JS37 347 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 AADACL3Q5VUY0 350 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 DCAF12L2Q5VW00 463 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 OR2A2Q6IF42 318 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 FBXW12Q6X9E4 464 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 WDR31Q8NA23 367 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC30A7Q8NEW0 376 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 OR5AP2Q8NGF4 316 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 OR5L1Q8NGL2 311 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 OR5M9Q8NGP3 310 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 GRPEL2Q8TAA5 225 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 MARCH1Q8TCQ1 289 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 MITD1Q8WV92 249 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 OR5P3Q8WZ94 311 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 SULT4A1Q9BR01 284 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 FAAP24Q9BTP7 215 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 AK3Q9UIJ7 227 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 EDARQ9UNE0 448 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 MPC1Q9Y5U8 109 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 ATMQ13315 3056 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 HMSDA8MTL9 139 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 PRSS44E7EML9 344 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 F5H5P2 479 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 GOSR2O14653 212 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 PDCD6O75340 191 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC22A5O76082 557 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 CELA3BP08861 270 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF35P13682 527 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 FPR2P25090 351 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 PER3P56645 1201 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 RBM11P57052 281 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 TAS2R31P59538 309 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 FOXF2Q12947 444 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 IKZF1Q13422 519 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 PIGYQ3MUY2 71 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 NKAPLQ5M9Q1 402 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 VWA1Q6PCB0 445 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 SEM1Q6ZVN7 128 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC25A26Q70HW3 274 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF767PQ75MW2 155 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 GCNT2Q8N0V5 402 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF611Q8N823 705 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 OR10AD1Q8NGE0 317 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM230Q96A57 120 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 PPA2Q9H2U2 334 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 C5orf66Q9H5L9 145 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 DECR2Q9NUI1 292 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC23A1Q9UHI7 598 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 ST3GAL6Q9Y274 331 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 COL6A6A6NMZ7 2263 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A0B4J2A0 478 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 DBX1A6NMT0 343 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF732B4DXR9 585 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 MCRIP1C9JLW8 97 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 K7EM74 188 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 LILRA1O75019 489 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 TNFSF13O75888 250 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 CD8AP01732 235 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 PPP3CBP16298 524 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 CXCL2P19875 107 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 FUT3P21217 361 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 CD34P28906 385 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 OR3A3P47888 321 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 NPBWR2P48146 333 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 TSPAN5P62079 268 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 IGFBP7Q16270 282 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 TBC1D28Q2M2D7 210 aa9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms