RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487565.5

GARNL3-218, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-218ENST00000487565 C1orf123Q9NWV4 160 aa6.47□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 IL19Q9UHD0 177 aa6.47□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 DAPK2Q9UIK4 370 aa6.47□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 ABCA12Q86UK0 2595 aa6.47□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 RTTNQ86VV8 2226 aa6.46□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 LRRC30A6NM36 301 aa6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 CD8AP01732 235 aa6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 UBBP0CG47 229 aa6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 IRF2P14316 349 aa6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 HTR2CP28335 458 aa6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 CDKN1AP38936 164 aa6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 RORCP51449 518 aa6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 CAPZA1P52907 286 aa6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 CAV3P56539 151 aa6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 ZP1P60852 638 aa6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 RIN1Q13671 783 aa6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 C1orf100Q5SVJ3 147 aa6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 IDNKQ5T6J7 187 aa6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 NR2C2APQ86WQ0 139 aa6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 ANGPTL5Q86XS5 388 aa6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 MKXQ8IYA7 352 aa6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 SCCPDHQ8NBX0 429 aa6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 OR4D6Q8NGJ1 314 aa6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 LGALS14Q8TCE9 139 aa6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 SLAMF9Q96A28 289 aa6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 PKIBQ9C010 78 aa6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 TLNRD1Q9H1K6 362 aa6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 OR51I2Q9H344 312 aa6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 STEAP1Q9UHE8 339 aa6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 EDARQ9UNE0 448 aa6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa6.46□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 A0A0B4J203 849 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 TRAPPC2LH3BP13 241 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 IFNL4K9M1U5 179 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 SYNGR1O43759 233 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 ANGPTL7O43827 346 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 TMEM127O75204 238 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 KDM4BO94953 1096 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 MPZP25189 248 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 PTGFRP43088 359 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 CLDN12P56749 244 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 IL13RA1P78552 427 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 IL24Q13007 206 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 MAB21L1Q13394 359 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 RSU1Q15404 277 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 MPPED2Q15777 294 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 DGUOKQ16854 277 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 SMIM21Q3B7S5 101 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 RNF144BQ7Z419 303 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 CALHM1Q8IU99 346 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 Q8IYB0 196 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 SAXO1Q8IYX7 474 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 LILRB2Q8N423 598 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 TBC1D15Q8TC07 691 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 Q8TCH9 128 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 LRRC29Q8WV35 223 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 ACOT12Q8WYK0 555 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 AQP3Q92482 292 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 ERGIC1Q969X5 290 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 CEP19Q96LK0 163 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 MRI1Q9BV20 369 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 BARHL1Q9BZE3 327 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 CST11Q9H112 138 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 METTL9Q9H1A3 318 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 KCNK15Q9H427 330 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 PTTG2Q9NZH5 202 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 IL36GQ9NZH8 169 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 GHRLQ9UBU3 117 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 ING4Q9UNL4 249 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 ETV7Q9Y603 341 aa6.45□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 CDIPTO14735 213 aa6.44□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 CDC14BO60729 498 aa6.44□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 NXPH2O95156 264 aa6.44□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 CSTBP04080 98 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 PGA5P0DJD9 388 aa6.44□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 CALCBP10092 127 aa6.44□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 ARSBP15848 533 aa6.44□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 BCL3P20749 454 aa6.44□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 SERPINA2P20848 420 aa6.44□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 CD80P33681 288 aa6.44□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 BMXP51813 675 aa6.44□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 EFNA4P52798 201 aa6.44□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 SCAND1P57086 179 aa6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms