RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481848.6

SOGA3-207, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS P5 TSL 5 BASIC

Gene SOGA3, Length 11,464 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-207ENST00000481848 OR4S2Q8NH73 311 aa11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF480Q8WV37 535 aa11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 CACNG5Q9UF02 275 aa11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 ADAM20O43506 726 aa11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 RELQ04864 619 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 HSPB7Q9UBY9 170 aa11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 PRSS56P0CW18 603 aa11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 FOLR3P41439 243 aa11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 CACNA1BQ00975 2339 aa11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 AVPR2P30518 371 aa11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 LGALS4P56470 323 aa11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 FUT7Q11130 342 aa11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 DUSP8Q13202 625 aa11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 C17orf78Q8N4C9 275 aa11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 MS4A18H0YCH9 400 aa11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 FTH1P19P0C7X4 201 aa11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 MMP9P14780 707 aa11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 MS4A18Q3C1V0 323 aa11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 HSFX1Q9UBD0 423 aa11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 CADP27708 2225 aa11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 CHST1O43916 411 aa11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 POU2F2P09086 479 aa11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 GAMTQ14353 236 aa11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 CLDN23Q96B33 292 aa11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 LYRM4Q9HD34 91 aa11.23□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 HOXB2P14652 356 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 JAG1P78504 1218 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 BTLAQ7Z6A9 289 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 NTNG1Q9Y2I2 539 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 CTNSO60931 367 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 SFTPCP11686 197 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 ACP1P24666 158 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 CLDN17P56750 224 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF141Q15928 474 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 ASCL3Q9NQ33 180 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 RGPD5Q99666 1765 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 A0A1B0GWB2 263 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 FAM72CH0Y354 149 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 ADRA1AP35348 466 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 FAM72AQ5TYM5 149 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 FAM72DQ6L9T8 149 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 FAM72BQ86X60 149 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 CA13Q8N1Q1 262 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 IRF7Q92985 503 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 DYNLRB1Q9NP97 96 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 A8MWL6 223 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 ZBTB25P24278 435 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 ASCL4Q6XD76 172 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 M0QZ24 198 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 CSNK1DP48730 415 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 TMPRSS3P57727 454 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 SKP2Q13309 424 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 CMTM8Q8IZV2 173 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 CTAG2O75638 210 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 WNK2Q9Y3S1 2297 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 SELENOPP49908 381 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 FUT6P51993 359 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 HS3ST1O14792 307 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 LYZL6O75951 148 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa11.22□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 CTAG1AP78358 180 aa11.21□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 NWD2Q9ULI1 1742 aa11.21□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 DYNLT3P51808 116 aa11.21□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 TNFRSF9Q07011 255 aa11.21□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 TAZQ16635 292 aa11.21□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 FAM71F2Q6NXP2 309 aa11.21□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 PIGTQ969N2 578 aa11.21□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 COL8A1P27658 744 aa11.21□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 SCAMP4Q969E2 229 aa11.21□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 HAPLN2Q9GZV7 340 aa11.21□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 FMODQ06828 376 aa11.21□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 C2orf27AQ580R0 203 aa11.21□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 SH2D5Q6ZV89 423 aa11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 316.8 ms