RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.53
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PRKCI-202ENST00000476635 ZNF222Q9UK12 451 aa5.46□□□□□ -1.53
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PRKCI-202ENST00000476635 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
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PRKCI-202ENST00000476635 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa5.45□□□□□ -1.54
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PRKCI-202ENST00000476635 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
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PRKCI-202ENST00000476635 CTXN2P0C2S0 81 aa5.45□□□□□ -1.54
PRKCI-202ENST00000476635 RPS2P15880 293 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
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