RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 RBFOX3A6NFN3 312 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM24AA6NFZ4 105 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 F5H5K5 113 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 NXPH3O95157 252 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 ONECUT2O95948 504 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 MDKP21741 143 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 CAPZBP47756 277 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 CD81P60033 236 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 RND3P61587 244 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 YPEL5P62699 121 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 HIKESHIQ53FT3 197 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 HIST3H2BBQ8N257 126 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 C17orf78Q8N4C9 275 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 OR2G3Q8NGZ4 309 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 LYZL4Q96KX0 146 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 LRP4O75096 1905 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A1W2PNR3 127 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 ADAM10O14672 748 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 IFNA10P01566 189 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 QDPRP09417 244 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 DDTP30046 118 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 GALNSP34059 522 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM187Q14656 261 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 OR14K1Q8NGZ2 314 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 PGAM5Q96HS1 289 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 LRRC61Q9BV99 259 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 SUCNR1Q9BXA5 334 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 THADAQ6YHU6 1953 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF724A8MTY0 619 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF814B7Z6K7 855 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 HSD17B6O14756 317 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 PPP1R2P9O14990 202 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 CSNK1A1P48729 337 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 PKIAP61925 76 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 TAF9Q16594 264 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 STX12Q86Y82 276 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 POM121Q96HA1 1249 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC187A0A096LP49 1063 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 SERPINE3A8MV23 424 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 EFNA2O43921 213 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 POU2F2P09086 479 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF728P0DKX0 622 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF43P17038 809 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 ATP6V0CP27449 155 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 LSM6P62312 80 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 PDCD1Q15116 288 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 GPR157Q5UAW9 335 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC38A9Q8NBW4 561 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 SSC4DQ8WTU2 575 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 MAGT1Q9H0U3 335 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 NAA60Q9H7X0 242 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 AK3Q9UIJ7 227 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 ANXA10Q9UJ72 324 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 TLCD2A6NGC4 264 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 LIPT2A6NK58 231 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF587BE7ETH6 402 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 IGHV4-34P06331 123 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 RUNX1Q01196 453 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP11.8□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 ZP4Q12836 540 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 MYBPHQ13203 477 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM189A2Q15884 450 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 OR2T2Q6IF00 324 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 SPSB3Q6PJ21 355 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 DOK3Q7L591 496 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF429Q86V71 674 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM234Q8WY98 164 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 DECR2Q9NUI1 292 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 ST8SIA3O43173 380 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 DBHP09172 617 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 ECI1P42126 302 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 BATF2Q8N1L9 274 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 GPHA2Q96T91 129 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 IER2Q9BTL4 223 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 MOB1AQ9H8S9 216 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 TCFL5Q9UL49 500 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 TNFSF12O43508 249 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 DCAF7P61962 342 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 DEFB119Q8N690 84 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM217Q8N7C4 229 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 NOXO1Q8NFA2 376 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 OR1N1Q8NGS0 311 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 OR13D1Q8NGV5 346 aa11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms