RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460759.1

NISCH-203, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 565 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-203ENST00000460759 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-203ENST00000460759 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-203ENST00000460759 TUBAL3A6NHL2 446 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-203ENST00000460759 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
NISCH-203ENST00000460759 PDCD6O75340 191 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-203ENST00000460759 AKAIN1P0CW23 69 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-203ENST00000460759 PGA5P0DJD9 388 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-203ENST00000460759 GNB3P16520 340 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-203ENST00000460759 BCL3P20749 454 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-203ENST00000460759 TNFSF4P23510 183 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-203ENST00000460759 GABRR1P24046 479 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-203ENST00000460759 SRP9P49458 86 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
NISCH-203ENST00000460759 TFF3Q07654 80 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-203ENST00000460759 ZNF154Q13106 437 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-203ENST00000460759 PCGF3Q3KNV8 242 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-203ENST00000460759 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
NISCH-203ENST00000460759 TMEM255AQ5JRV8 349 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-203ENST00000460759 GDPD3Q7L5L3 318 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-203ENST00000460759 NRARPQ7Z6K4 114 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-203ENST00000460759 TMEM229BQ8NBD8 167 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-203ENST00000460759 SCCPDHQ8NBX0 429 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-203ENST00000460759 DUSP18Q8NEJ0 188 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-203ENST00000460759 ST8SIA4Q92187 359 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-203ENST00000460759 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-203ENST00000460759 PECRQ9BY49 303 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-203ENST00000460759 IFT46Q9NQC8 304 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-203ENST00000460759 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-203ENST00000460759 MTCH1Q9NZJ7 389 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-203ENST00000460759 TAAR3PQ9P1P4 343 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-203ENST00000460759 KLK11Q9UBX7 282 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-203ENST00000460759 POU2F3Q9UKI9 436 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-203ENST00000460759 FZR1Q9UM11 496 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-203ENST00000460759 PCNX1Q96RV3 2341 aa10.96□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 MEIOCA2RUB1 952 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 SYNGR1O43759 233 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 GLAP06280 429 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 ADH4P08319 380 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 CHATP28329 748 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 SLC6A1P30531 599 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 RFX2P48378 723 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 TMEM50BP56557 158 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 TAF9Q16594 264 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 NKPD1Q17RQ9 610 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 ACTBL2Q562R1 376 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 PLAC9Q5JTB6 97 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 VHLLQ6RSH7 139 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 PLET1Q6UQ28 207 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 Q6ZR03 302 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 WDR86Q86TI4 376 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 FAM58AQ8N1B3 248 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 POC1AQ8NBT0 407 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 OR10AD1Q8NGE0 317 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 OR10Z1Q8NGY1 313 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 ERGIC1Q969X5 290 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 ELMOD3Q96FG2 381 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 PLPPR2Q96GM1 343 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 SYT3Q9BQG1 590 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 DPAGT1Q9H3H5 408 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 IFT22Q9H7X7 185 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 ANAPC10Q9UM13 185 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 RNF115Q9Y4L5 304 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 PRR14LQ5THK1 2151 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 WIPF3A6NGB9 483 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 PTHLHP12272 177 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 FUT3P21217 361 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 GATA4P43694 442 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 UQCRFS1P47985 274 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 NPBWR2P48146 333 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 ZNF81P51508 661 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 ERVK11-1P61568 191 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 GUCA2AQ02747 115 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 ARFRP1Q13795 201 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 MEF2DQ14814 521 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 ZMYND11Q15326 602 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 ADIPOQQ15848 244 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 MSMPQ1L6U9 139 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 PIGYQ3MUY2 71 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 SPIN3Q5JUX0 258 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 OR2Z1Q8NG97 314 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 CREB3L1Q96BA8 519 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 NRIP2Q9BQI9 281 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 OCSTAMPQ9BR26 566 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 CHST6Q9GZX3 395 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 MSL2Q9HCI7 577 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 HRASLSQ9HDD0 168 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 FAIMQ9NVQ4 179 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 RASL12Q9NYN1 266 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
NISCH-203ENST00000460759 IL19Q9UHD0 177 aa10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms