RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460589.5

RPL3-208, Transcript of ribosomal protein L3, human

TSL 2

Gene RPL3, Length 630 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL3-208	ENST00000460589	GPR173	Q9NS66	373 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	ACOD1	A6NK06	481 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	F2RL2	O00254	374 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	NRAS	P01111	189 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	TTR	P02766	147 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	HMGN1	P05114	100 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	PF4V1	P10720	104 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	DAP	P51397	102 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	SLC35A2	P78381	396 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	GINS1	Q14691	196 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	ZSCAN26	Q16670	478 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	COMMD2	Q86X83	199 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	ZNF573	Q86YE8	665 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	MYDGF	Q969H8	173 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	KRT84	Q9NSB2	600 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	COPS3	Q9UNS2	423 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589		H3BNX3	289 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	DHRS3	O75911	302 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	ESRRG	P62508	458 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	ACTA2	P62736	377 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	ACTG2	P63267	376 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	ACTC1	P68032	377 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	ACTA1	P68133	377 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	CDK5	Q00535	292 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	ROM1	Q03395	351 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	SLC34A1	Q06495	639 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589		V9GYS6	101 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	TMEM82	A0PJX8	343 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	CCDC182	A6NF36	153 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589		A6NIN4	97 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	PF4	P02776	101 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	CD24	P25063	80 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	CRISP1	P54107	249 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	EDDM3B	P56851	147 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	ITFG2	Q969R8	447 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	S100A14	Q9HCY8	104 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RPL3-208	ENST00000460589	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPL3-208	ENST00000460589		A0A1B0GTI1	187 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPL3-208	ENST00000460589	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPL3-208	ENST00000460589	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RPL3-208	ENST00000460589	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPL3-208	ENST00000460589	DLGAP1	O14490	977 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPL3-208	ENST00000460589	MMP23A	O75900	390 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPL3-208	ENST00000460589	AMY1A	P04745	511 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPL3-208	ENST00000460589	AMY2A	P04746	511 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPL3-208	ENST00000460589	ALDOB	P05062	364 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPL3-208	ENST00000460589	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RPL3-208	ENST00000460589	OR12D2	P58182	307 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPL3-208	ENST00000460589	APOF	Q13790	326 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPL3-208	ENST00000460589	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPL3-208	ENST00000460589	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPL3-208	ENST00000460589	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPL3-208	ENST00000460589		Q6ZSR3	168 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPL3-208	ENST00000460589	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPL3-208	ENST00000460589	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPL3-208	ENST00000460589	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPL3-208	ENST00000460589	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPL3-208	ENST00000460589	STMN2	Q93045	179 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPL3-208	ENST00000460589	ZNF714	Q96N38	554 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPL3-208	ENST00000460589	B9D2	Q9BPU9	175 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPL3-208	ENST00000460589	MRO	Q9BYG7	248 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPL3-208	ENST00000460589	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPL3-208	ENST00000460589	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPL3-208	ENST00000460589	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPL3-208	ENST00000460589	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPL3-208	ENST00000460589	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPL3-208	ENST00000460589	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RPL3-208	ENST00000460589	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPL3-208	ENST00000460589	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RPL3-208	ENST00000460589	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24

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