RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438233.2

CYCSP43-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 43, humanhuman

BASIC

Gene CYCSP43, Length 310 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP43-201ENST00000438233 HMGCS1Q01581 520 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 ST3GAL3Q11203 375 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 SKP2Q13309 424 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 KCNJ11Q14654 390 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 SLC10A1Q14973 349 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 SPHARQ15513 63 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 NSDHLQ15738 373 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 DGUOKQ16854 277 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 ENPP6Q6UWR7 440 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 Q6ZSR3 168 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 LINC00336Q6ZUF6 198 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 SSX7Q7RTT5 188 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 SSX6Q7RTT6 188 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 OR2W3Q7Z3T1 314 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 RIMKLAQ8IXN7 391 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 LGI3Q8N145 548 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 STPG2Q8N412 459 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 MREGQ8N565 214 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 GCSAMQ8N6F7 178 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 ZNF740Q8NDX6 193 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 OR2AK2Q8NG84 335 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 OR6M1Q8NGM8 313 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 OR10X1Q8NGY0 326 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 OR6K3Q8NGY3 331 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 SSMEM1Q8WWF3 244 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 TMEM56Q96MV1 263 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 ATF6BQ99941 703 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 AIF1LQ9BQI0 150 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 NEURL2Q9BR09 285 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 KIFC1Q9BW19 673 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 PRRG4Q9BZD6 226 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 TMEM27Q9HBJ8 222 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 NMRAL1Q9HBL8 299 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 ISYNA1Q9NPH2 558 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 SLC17A5Q9NRA2 495 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 FAIMQ9NVQ4 179 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 IL36GQ9NZH8 169 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 GALPQ9UBC7 116 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 WDR83OSQ9Y284 106 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 TMED3Q9Y3Q3 217 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 PLCE1Q9P212 2302 aa3.26□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 BIRC6Q9NR09 4857 aa3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 PQLC2LA1A4F0 135 aa3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 SLC22A20A6NK97 555 aa3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 E5RGE8 158 aa3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 F5H768 121 aa3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 UBDO15205 165 aa3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 PFDN6O15212 129 aa3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 CHP2O43745 196 aa3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 XPNPEP2O43895 674 aa3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 LRATO95237 230 aa3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 IGHV4-39P01824 125 aa3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 IGF1P05019 195 aa3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 FBP1P09467 338 aa3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 OR8U9P0C7N5 309 aa3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 CT45A8P0DMV1 189 aa3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 CT45A9P0DMV2 189 aa3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 COX4I1P13073 169 aa3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 GABRA1P14867 456 aa3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 DAOP14920 347 aa3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 UQCRBP14927 111 aa3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 FUT3P21217 361 aa3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 LMO1P25800 156 aa3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 IMPA1P29218 277 aa3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 CMPK1P30085 196 aa3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 GNRHRP30968 328 aa3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 PMELP40967 661 aa3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 RAB13P51153 203 aa3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 SSR4P51571 173 aa3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 CAV2P51636 162 aa3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 FUT6P51993 359 aa3.25□□□□□ -1.89
CYCSP43-201ENST00000438233 CLDN12P56749 244 aa3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms