RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428098.5

DDX39B-208, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 817 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-208ENST00000428098 RNLSQ5VYX0 342 aa9.17□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 MOB3CQ70IA8 216 aa9.17□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 RTN4RL2Q86UN3 420 aa9.17□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 CATSPERDQ86XM0 798 aa9.17□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 LYPD6Q86Y78 171 aa9.17□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 OR8H2Q8N162 312 aa9.17□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 OR56B4Q8NH76 319 aa9.17□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 ZNF596Q8TC21 504 aa9.17□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 MYOZ3Q8TDC0 251 aa9.17□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 RNF133Q8WVZ7 376 aa9.17□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 ABHD6Q9BV23 337 aa9.17□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 HIPK2Q9H2X6 1198 aa9.17□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 ANKRD19PQ9H560 264 aa9.17□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 A0A1W2PRQ8 180 aa9.16□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 TMEM120BA0PK00 339 aa9.16□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 OR5B21A6NL26 309 aa9.16□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 PSMD9O00233 223 aa9.16□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 BRI3O95415 125 aa9.16□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 GYPBP06028 91 aa9.16□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 TMEM11P17152 192 aa9.16□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 PSMB8P28062 276 aa9.16□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 CD34P28906 385 aa9.16□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 OPRL1P41146 370 aa9.16□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 MNDAP41218 407 aa9.16□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 RUNX1Q01196 453 aa9.16□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 DGCR6Q14129 220 aa9.16□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa9.16□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 HES1Q14469 280 aa9.16□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 HLA-DRB5Q30154 266 aa9.16□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 ACSM6Q6P461 480 aa9.16□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 ERICH5Q6P6B1 374 aa9.16□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 SGPP2Q8IWX5 399 aa9.16□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa9.16□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 FUZQ9BT04 418 aa9.16□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa9.16□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 PKHD1P08F94 4074 aa9.16□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 J3QT63 122 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 IDH3BO43837 385 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 IGHA1P01876 353 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 APOC1P02654 83 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 H1F0P07305 194 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 CDK2P24941 298 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 FMO3P31513 532 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 CEACAM3P40198 252 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 HAAOP46952 286 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 SLURP1P55000 103 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 ZNF491Q8N8L2 437 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 OR2T4Q8NH00 348 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 FANK1Q8TC84 345 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 ARPC1AQ92747 370 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 ITFG2Q969R8 447 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 SNX22Q96L94 193 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 VIPAS39Q9H9C1 493 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 CD300AQ9UGN4 299 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 A0A1W2PPI3 338 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 OOSP1A8MZH6 123 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 C12orf77C9JDV5 145 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 PSPNO60542 156 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 CLUP10909 449 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 ARSBP15848 533 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 VSNL1P62760 191 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 IFI44LQ53G44 452 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 HEPN1Q6WQI6 88 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 ANGPTL5Q86XS5 388 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 OR8B12Q8NGG6 310 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 UBE2E2Q96LR5 201 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 GON7Q9BXV9 100 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 CHST6Q9GZX3 395 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 ABCG5Q9H222 651 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 RABEP2Q9H5N1 569 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 ENPP4Q9Y6X5 453 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 DNAH11Q96DT5 4516 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 TOR1AO14656 332 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 ZNF682O95780 498 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 SERPINA1P01009 418 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 MED14OSP0DP75 135 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 MAP2K3P46734 347 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 CBX1P83916 185 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 GRK1Q15835 563 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 PLCXD3Q63HM9 321 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 OR52W1Q6IF63 320 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 SLC37A3Q8NCC5 494 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 OR8J3Q8NGG0 315 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 OR52J3Q8NH60 311 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 TSPEARQ8WU66 669 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 EME1Q96AY2 570 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 CREB3L1Q96BA8 519 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 SH3GL1Q99961 368 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 PLSCR3Q9NRY6 295 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 DNAH17Q9UFH2 4485 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 DIRAS1O95057 198 aa9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms