RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423945.5

SBDSP1-202, Transcript of SBDS, ribosome maturation factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SBDSP1, Length 618 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBDSP1-202ENST00000423945 CAPZA1P52907 286 aa14.59□□□□□ -0.07
SBDSP1-202ENST00000423945 ATP1B3P54709 279 aa14.59□□□□□ -0.07
SBDSP1-202ENST00000423945 COL10A1Q03692 680 aa14.59□□□□□ -0.07
SBDSP1-202ENST00000423945 KLHL22Q53GT1 634 aa14.59□□□□□ -0.07
SBDSP1-202ENST00000423945 TMEM200BQ69YZ2 307 aa14.59□□□□□ -0.07
SBDSP1-202ENST00000423945 LDLRAD3Q86YD5 345 aa14.59□□□□□ -0.07
SBDSP1-202ENST00000423945 FAM185AQ8N0U4 392 aa14.59□□□□□ -0.07
SBDSP1-202ENST00000423945 ZNF676Q8N7Q3 588 aa14.59□□□□□ -0.07
SBDSP1-202ENST00000423945 OR4M1Q8NGD0 313 aa14.59□□□□□ -0.07
SBDSP1-202ENST00000423945 OR13C3Q8NGS6 347 aa14.59□□□□□ -0.07
SBDSP1-202ENST00000423945 CYGBQ8WWM9 190 aa14.59□□□□□ -0.07
SBDSP1-202ENST00000423945 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SBDSP1-202ENST00000423945 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SBDSP1-202ENST00000423945 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa14.59□□□□□ -0.07
SBDSP1-202ENST00000423945 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SBDSP1-202ENST00000423945 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa14.58□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 K7N7A8 449 aa14.58□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 IGKV1D-12P01611 117 aa14.58□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 IGHV4-59P01825 116 aa14.58□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 MT-ND2P03891 347 aa14.58□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 BCL3P20749 454 aa14.58□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 ERVFRD-1P60508 538 aa14.58□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 FOXL1Q12952 345 aa14.58□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 ZNF273Q14593 569 aa14.58□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 TMEM86BQ8N661 226 aa14.58□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 OR13C9Q8NGT0 318 aa14.58□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 RFT1Q96AA3 541 aa14.58□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 OPALINQ96PE5 141 aa14.58□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 SPACA5Q96QH8 159 aa14.58□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 TMEM82A0PJX8 343 aa14.57□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 FAM181BA6NEQ2 426 aa14.57□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 NPFFO15130 113 aa14.57□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 CALCBP10092 127 aa14.57□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 CCL3L1P16619 93 aa14.57□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 PRKACBP22694 351 aa14.57□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 IER3P46695 156 aa14.57□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 POU3F4P49335 361 aa14.57□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 DLX6P56179 175 aa14.57□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 MTCP1P56278 107 aa14.57□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 RPL31P62899 125 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 RELBQ01201 579 aa14.57□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 PDZK1IP1Q13113 114 aa14.57□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 OR2G6Q5TZ20 316 aa14.57□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 TTC23Q5W5X9 447 aa14.57□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 ASPHD2Q6ICH7 369 aa14.57□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 LAIR2Q6ISS4 152 aa14.57□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa14.57□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 MKXQ8IYA7 352 aa14.57□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 C3orf56Q8N813 242 aa14.57□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 OR5AK2Q8NH90 309 aa14.57□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 RPS4Y2Q8TD47 263 aa14.57□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 SPSB1Q96BD6 273 aa14.57□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 AJUBAQ96IF1 538 aa14.57□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 FAM234AQ9H0X4 552 aa14.57□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 C8orf4Q9NR00 106 aa14.57□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 POMT1Q9Y6A1 747 aa14.57□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa14.56□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 TMEM212A6NML5 194 aa14.56□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 ANGPTL7O43827 346 aa14.56□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 LALBAP00709 142 aa14.56□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 CHRM2P08172 466 aa14.56□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 GNAO1P09471 354 aa14.56□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 OMGP23515 440 aa14.56□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 SAA4P35542 130 aa14.56□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 UBE2E1P51965 193 aa14.56□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 GUCA2AQ02747 115 aa14.56□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 C17orf107Q6ZR85 190 aa14.56□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 TCF23Q7RTU1 214 aa14.56□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 DHRSXQ8N5I4 330 aa14.56□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 PARP16Q8N5Y8 322 aa14.56□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 OR52N4Q8NGI2 321 aa14.56□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 C17orf50Q8WW18 174 aa14.56□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 SSMEM1Q8WWF3 244 aa14.56□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa14.56□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 ZNRD1Q9P1U0 126 aa14.56□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 CLEC2DQ9UHP7 191 aa14.56□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 H0YAE9 185 aa14.55□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 HAND1O96004 215 aa14.55□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 CCDC159P0C7I6 412 aa14.55□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 PIPP12273 146 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 MDKP21741 143 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 DCKP27707 260 aa14.55□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 DUSP1P28562 367 aa14.55□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 BLMHQ13867 455 aa14.55□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 NCR3LG1Q68D85 454 aa14.55□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 FAM58AQ8N1B3 248 aa14.55□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 OR5D18Q8NGL1 313 aa14.55□□□□□ -0.08
SBDSP1-202ENST00000423945 ZNF747Q9BV97 191 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.8 ms