RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM211Q6ICI0 200 aa17.96■□□□□ 0.47
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF561Q8N587 486 aa17.96■□□□□ 0.47
CCSAP-203ENST00000366687 RPEQ96AT9 228 aa17.96■□□□□ 0.47
CCSAP-203ENST00000366687 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
CCSAP-203ENST00000366687 hADV38S2A0JD32 116 aa17.96■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 TM4SF19Q96DZ7 209 aa17.96■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 PRR27Q6MZM9 219 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 SEC14L6B5MCN3 397 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 ONECUT2O95948 504 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 RAB32Q13637 225 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM88Q6PEY1 159 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 C10orf35Q96D05 121 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 SIGLEC14Q08ET2 396 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 PLAC9Q5JTB6 97 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 ZDHHC16Q969W1 377 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1W2PQF6 199 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 MPC2O95563 127 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 CCL2P13500 99 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 FOSL1P15407 271 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 PJVKQ0ZLH3 352 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 GUK1Q16774 197 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 ZAR1Q86SH2 424 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 ACTL6AO96019 429 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 Q3ZCU0 254 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 GGNBP1Q5YKI7 109 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 DUSP18Q8NEJ0 188 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 CCL17Q92583 94 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB44Q8NCP5 570 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 OR6C3Q9NZP0 311 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF320A2RRD8 509 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 CALCRP30988 508 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 HRKO00198 91 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 PAX6P26367 422 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 SLC38A11Q08AI6 406 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 MIDNQ504T8 468 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 FAHD2AQ96GK7 314 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 CXXC4Q9H2H0 198 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 FSCN3Q9NQT6 498 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 FZR1Q9UM11 496 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 SLC6A1P30531 599 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 GNG10P50151 68 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 SOX8P57073 446 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 OR2C3Q8N628 320 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 OR5C1Q8NGR4 320 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 WDR13Q9H1Z4 485 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 FRRS1LQ9P0K9 344 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 OR4C45A6NMZ5 311 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 DEFB108AA8MXU0 73 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 SDHBP21912 280 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM18Q96B42 140 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 AKR1E2Q96JD6 320 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 MAP6Q96JE9 813 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC3BQ96PB8 259 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 SLC26A1Q9H2B4 701 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 IL36GQ9NZH8 169 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 CACNG5Q9UF02 275 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 OR3A1P47881 315 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 OR5I1Q13606 314 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 IL13RA2Q14627 380 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 CLEC12BQ2HXU8 276 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 PRSS54Q6PEW0 395 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 CTDSPLO15194 276 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 FGF2P09038 288 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 GPR137Q96N19 417 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 WSB1Q9Y6I7 421 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 LURAP1Q96LR2 239 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 FKBP11Q9NYL4 201 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 M0R296 226 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 CST2P09228 141 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 CPN1P15169 458 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 C10orf111Q8N326 155 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 TGIF2Q9GZN2 237 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 ANXA10Q9UJ72 324 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 DNPH1O43598 174 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 MPGP29372 298 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 C4orf17Q53FE4 359 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 GVQW1Q8N7I0 195 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 OR5AC1P0C628 307 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-203ENST00000366687 COL19A1Q14993 1142 aa17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.5 ms