RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356924.8

ABCD4-201, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ABCD4, Length 3,003 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-201ENST00000356924 ZNF584Q8IVC4 421 aa9.61□□□□□ -0.87
ABCD4-201ENST00000356924 KCNRGQ8N5I3 272 aa9.61□□□□□ -0.87
ABCD4-201ENST00000356924 CCDC54Q8NEL0 328 aa9.61□□□□□ -0.87
ABCD4-201ENST00000356924 ZNF75AQ96N20 296 aa9.61□□□□□ -0.87
ABCD4-201ENST00000356924 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
ABCD4-201ENST00000356924 DCAF16Q9NXF7 216 aa9.61□□□□□ -0.87
ABCD4-201ENST00000356924 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
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ABCD4-201ENST00000356924 ARR3P36575 388 aa9.61□□□□□ -0.87
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ABCD4-201ENST00000356924 TREM1Q9NP99 234 aa9.61□□□□□ -0.87
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ABCD4-201ENST00000356924 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
ABCD4-201ENST00000356924 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
ABCD4-201ENST00000356924 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
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ABCD4-201ENST00000356924 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
ABCD4-201ENST00000356924 PIGLQ9Y2B2 252 aa9.61□□□□□ -0.87
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ABCD4-201ENST00000356924 UBE2V2Q15819 145 aa9.6□□□□□ -0.87
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ABCD4-201ENST00000356924 C10orf35Q96D05 121 aa9.6□□□□□ -0.87
ABCD4-201ENST00000356924 POM121L2Q96KW2 1035 aa9.6□□□□□ -0.87
ABCD4-201ENST00000356924 SPACA5Q96QH8 159 aa9.6□□□□□ -0.87
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ABCD4-201ENST00000356924 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
ABCD4-201ENST00000356924 FAM215AQ9Y5M1 114 aa9.6□□□□□ -0.87
ABCD4-201ENST00000356924 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa9.6□□□□□ -0.87
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ABCD4-201ENST00000356924 CCL2P13500 99 aa9.6□□□□□ -0.87
ABCD4-201ENST00000356924 TDGF1P3P51864 188 aa9.6□□□□□ -0.87
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ABCD4-201ENST00000356924 FAM3AP98173 230 aa9.59□□□□□ -0.87
ABCD4-201ENST00000356924 ZNF345Q14585 488 aa9.59□□□□□ -0.87
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ABCD4-201ENST00000356924 Q6ZT83 130 aa9.59□□□□□ -0.87
ABCD4-201ENST00000356924 MDP1Q86V88 176 aa9.59□□□□□ -0.87
ABCD4-201ENST00000356924 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa9.59□□□□□ -0.87
ABCD4-201ENST00000356924 CHST5Q9GZS9 411 aa9.59□□□□□ -0.87
ABCD4-201ENST00000356924 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa9.59□□□□□ -0.87
ABCD4-201ENST00000356924 UFSP2Q9NUQ7 469 aa9.59□□□□□ -0.87
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ABCD4-201ENST00000356924 OR10K2Q6IF99 312 aa9.59□□□□□ -0.87
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ABCD4-201ENST00000356924 RPRMLQ8N4K4 120 aa9.59□□□□□ -0.87
ABCD4-201ENST00000356924 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
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ABCD4-201ENST00000356924 STARD4Q96DR4 205 aa9.59□□□□□ -0.87
ABCD4-201ENST00000356924 RGCCQ9H4X1 137 aa9.59□□□□□ -0.87
ABCD4-201ENST00000356924 SPTBN2O15020 2390 aa9.58□□□□□ -0.88
ABCD4-201ENST00000356924 C5orf49A4QMS7 147 aa9.58□□□□□ -0.88
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