RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP14.42□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP14.42□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP14.42□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 RFPL4AA6NLU0 287 aa14.42□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 OR4C45A6NMZ5 311 aa14.42□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 C3orf80F5H4A9 247 aa14.42□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa14.42□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 ADAM20O43506 726 aa14.42□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 IFI6P09912 130 aa14.42□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC25A6P12236 298 aa14.42□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 CEACAM3P40198 252 aa14.42□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 P2RX3P56373 397 aa14.42□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRTM1Q86UE6 522 aa14.42□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF439Q8NDP4 499 aa14.42□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 HES4Q9HCC6 221 aa14.42□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa14.42□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 UMAD1C9J7I0 102 aa14.42□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 COX7A2P2O60397 106 aa14.42□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 C11orf87Q6NUJ2 197 aa14.42□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 NARFLQ9H6Q4 476 aa14.42□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 FRRS1LQ9P0K9 344 aa14.42□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 MASP2O00187 686 aa14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 PNPP00491 289 aa14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 GNG10P50151 68 aa14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 MMP16P51512 607 aa14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 PRRX1P54821 245 aa14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 OR2B8PP59922 312 aa14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP5D1E7EU14 171 aa14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 TSTD3H0UI37 97 aa14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 FCGR3BO75015 233 aa14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 PLPPR5Q32ZL2 321 aa14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 ST8SIA2Q92186 375 aa14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 PRSS44E7EML9 344 aa14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 AKR7A2O43488 359 aa14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 SFT2D2O95562 160 aa14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 DHRS2Q13268 280 aa14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB40CQ96S21 281 aa14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 TTTY12Q9BZ98 90 aa14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 RASL12Q9NYN1 266 aa14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 GAB2Q9UQC2 676 aa14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 DOCK3Q8IZD9 2030 aa14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 METTL15P1P0C7V9 234 aa14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 FGF7P21781 194 aa14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 ARID1AO14497 2285 aa14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 CST7O76096 145 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 KIR2DS2P43631 304 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 OR3A1P47881 315 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 Q3ZCU0 254 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF680Q8NEM1 530 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC26A10Q8NG04 563 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 MOB3AQ96BX8 217 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 ACY3Q96HD9 319 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 ADTRPQ96IZ2 230 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 MAP6Q96JE9 813 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 SEMG1P04279 462 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 OR10AD1Q8NGE0 317 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 ASB5Q8WWX0 329 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 NTNG2Q96CW9 530 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC52A3Q9NQ40 469 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 SVILO95425 2214 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 TUBAL3A6NHL2 446 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 TO15178 435 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 OIP5O43482 229 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 NTN1O95631 604 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 LPAR6P43657 344 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM104Q8NE00 496 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 OR2T6Q8NHC8 308 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 NAA60Q9H7X0 242 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 PCM1Q15154 2024 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 J3QT63 122 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 FBP1P09467 338 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 RPS2P15880 293 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 MS4A5Q9H3V2 200 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 FKBP11Q9NYL4 201 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 NINQ8N4C6 2090 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 DEFB108AA8MXU0 73 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 ZP4Q12836 540 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP1R1AQ13522 171 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 SPICQ8N5J4 248 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 MRGPRDQ8TDS7 321 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 MITD1Q8WV92 249 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 TGIF2Q9GZN2 237 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 UQCC1Q9NVA1 299 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 C16orf97H3BN30 126 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 IGKV1D-16P01601 117 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 PMP22Q01453 160 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 XKRY2A2RUG3 117 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 LYPD8Q6UX82 237 aa14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.7 ms