RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF3P17036 446 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 CD24P25063 80 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 ACKR3P25106 362 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 POU3F4P49335 361 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 TSPAN31Q12999 210 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 HES1Q14469 280 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 EDDM3AQ14507 147 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHL12Q53G59 568 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 LCE3BQ5TA77 95 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 PRSS45Q7RTY3 260 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 SATL1Q86VE3 508 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 ENTHD1Q8IYW4 607 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 STPG2Q8N412 459 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4P4Q8NGL7 312 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 RPEQ96AT9 228 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 OR8B4Q96RC9 309 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 SPATA25Q9BR10 227 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 ABHD6Q9BV23 337 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 IL1RAPQ9NPH3 570 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 NDUFAF4Q9P032 175 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0G2JND7 137 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0U1RQV5 110 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 FXYD1O00168 92 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 CYB5AP00167 134 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 NRASP01111 189 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM11P17152 192 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 SPI1P17947 270 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 VDAC1P21796 283 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 MYF6P23409 242 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 RRM2P31350 389 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 OPRL1P41146 370 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR12P47775 334 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 ESRRGP62508 458 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 LIPEQ05469 1076 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXE3Q13461 319 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR50Q13585 617 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 OVCH2Q7RTZ1 564 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 SGPP2Q8IWX5 399 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 Q8IYB0 196 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF511Q8NB15 262 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC37A3Q8NCC5 494 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4D6Q8NGJ1 314 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 THEM6Q8WUY1 208 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 TOMM40LQ969M1 308 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 EME1Q96AY2 570 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 DUX3Q96PT4 197 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 PKIBQ9C010 78 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 SCOCQ9UIL1 159 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC7A11Q9UPY5 501 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 CDH10Q9Y6N8 788 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 RYR2Q92736 4967 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 MGST3O14880 152 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 SASH3O75995 380 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHG2P01859 326 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 AMY1AP04745 511 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 AMY2AP04746 511 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 GABRR1P24046 479 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 GSTT1P30711 240 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 CRMP1Q14194 572 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 GRK1Q15835 563 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 HLA-DRB5Q30154 266 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 CLVS2Q5SYC1 327 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 HEPN1Q6WQI6 88 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT74Q7RTS7 529 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT77Q7Z794 578 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 PGAM4Q8N0Y7 254 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2T33Q8NG76 320 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 OR11H1Q8NG94 326 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 DHRS1Q96LJ7 313 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 PARD6BQ9BYG5 372 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 TAS2R3Q9NYW6 316 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAJB9Q9UBS3 223 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 HHLA2Q9UM44 414 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 PIGLQ9Y2B2 252 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa6.18□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 DLGAP1O14490 977 aa6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms