RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261443.9

CSDE1-201, Transcript of cold shock domain containing E1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSDE1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1-201ENST00000261443 TMEM210A6NLX4 147 aa6.33□□□□□ -1.4
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CSDE1-201ENST00000261443 MSX1P28360 303 aa6.33□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 FMODQ06828 376 aa6.33□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 FOXF1Q12946 379 aa6.33□□□□□ -1.4
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CSDE1-201ENST00000261443 TMEM187Q14656 261 aa6.33□□□□□ -1.4
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CSDE1-201ENST00000261443 GAL3ST4Q96RP7 486 aa6.33□□□□□ -1.4
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CSDE1-201ENST00000261443 SLC37A1P57057 533 aa6.33□□□□□ -1.4
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CSDE1-201ENST00000261443 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.33□□□□□ -1.4
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CSDE1-201ENST00000261443 APODP05090 189 aa6.33□□□□□ -1.4
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CSDE1-201ENST00000261443 HSF1Q00613 529 aa6.33□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 CLN3Q13286 438 aa6.33□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 DMRTC1Q5HYR2 192 aa6.33□□□□□ -1.4
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CSDE1-201ENST00000261443 CCDC3Q9BQI4 270 aa6.33□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.33□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.33□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 IGSF23A1L1A6 192 aa6.32□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 ZFP92A6NM28 416 aa6.32□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 SERPINE3A8MV23 424 aa6.32□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 PPP5D1E7EU14 171 aa6.32□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 DXOO77932 396 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 HLA-DOBP13765 273 aa6.32□□□□□ -1.4
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CSDE1-201ENST00000261443 RUNX1Q01196 453 aa6.32□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 PHLDA2Q53GA4 152 aa6.32□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 LILRA6Q6PI73 481 aa6.32□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 DNM1P34Q6PK57 102 aa6.32□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 LIAT1Q6ZQX7 453 aa6.32□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 PRSS58Q8IYP2 241 aa6.32□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 LGI3Q8N145 548 aa6.32□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.32□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 OR5L1Q8NGL2 311 aa6.32□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 C18orf12Q96KH6 178 aa6.32□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 DIRC2Q96SL1 478 aa6.32□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 FAAP24Q9BTP7 215 aa6.32□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.32□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 DEC1Q9P2X7 70 aa6.32□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa6.32□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa6.32□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 CD55P08174 381 aa6.32□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF728P0DKX0 622 aa6.32□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 ATXN8OSP0DMR3 200 aa6.32□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 TMEM225BP0DP42 221 aa6.32□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 PDLIM4P50479 330 aa6.32□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 FXYD4P59646 89 aa6.32□□□□□ -1.4
CSDE1-201ENST00000261443 ERVS71-1P61550 626 aa6.32□□□□□ -1.4
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