RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640511.1

SPIN3-241, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 3,102 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-241ENST00000640511 RNF212BA8MTL3 300 aa10.37□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 ABHD16AO95870 558 aa10.37□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 RBMXP38159 391 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 FAM90A2PQ658T7 463 aa10.37□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 FAM180AQ6UWF9 173 aa10.37□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 Q6ZN92 141 aa10.37□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 TPRG1Q6ZUI0 275 aa10.37□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 SLC16A9Q7RTY1 509 aa10.37□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 STXBP6Q8NFX7 210 aa10.37□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 VN1R17PQ8TDU5 208 aa10.37□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 UQCR10Q9UDW1 63 aa10.37□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 TBX21Q9UL17 535 aa10.37□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 CKMP06732 381 aa10.37□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 RBPJQ06330 500 aa10.37□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 TAF10Q12962 218 aa10.37□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 SAMD13Q5VXD3 122 aa10.37□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 DPPA3Q6W0C5 159 aa10.37□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 SAXO1Q8IYX7 474 aa10.37□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 FAM3CQ92520 227 aa10.37□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 ADIPOR1Q96A54 375 aa10.37□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 PTX4Q96A99 478 aa10.37□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 TIFAQ96CG3 184 aa10.37□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 BET1LQ9NYM9 111 aa10.37□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa10.37□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 A0A0C4DFX4 3053 aa10.37□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 TMEM225Q6GV28 225 aa10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 TMEM256Q8N2U0 113 aa10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 D2HGDHQ8N465 521 aa10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 OR51G1Q8NGK1 321 aa10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 SPTBP11277 2137 aa10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 TRAV34A0A0B4J273 112 aa10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 A0A1B0GV72 72 aa10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 C9orf172C9J069 976 aa10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 CORTO00230 105 aa10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 LYPD3O95274 346 aa10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 FAHP16930 419 aa10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 ZNF43P17038 809 aa10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 LGALS7P47929 136 aa10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 TMEM41BQ5BJD5 291 aa10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 ERASQ7Z444 233 aa10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 OR1E3Q8WZA6 343 aa10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 NLRC5Q86WI3 1866 aa10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 WIPF3A6NGB9 483 aa10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 C4orf47A7E2U8 309 aa10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 TSPAN6O43657 245 aa10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 C1orf105O95561 183 aa10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 DDAH2O95865 285 aa10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 HBE1P02100 147 aa10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 GALR1P47211 349 aa10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 PRRX1P54821 245 aa10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 RAB38P57729 211 aa10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 RHOGP84095 191 aa10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 LINC01590Q5TEZ4 76 aa10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 SYT13Q7L8C5 426 aa10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 OR4B1Q8NGF8 309 aa10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 FAM46BQ96A09 425 aa10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 Q9N2K0 584 aa10.36□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 A0A1B0GUS0 222 aa10.35□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 ARL5CA6NH57 179 aa10.35□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 ONECUT2O95948 504 aa10.35□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 CSNK1A1P48729 337 aa10.35□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 VASPP50552 380 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 VAX1Q5SQQ9 334 aa10.35□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 C16orf82Q7Z2V1 217 aa10.35□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 OR11L1Q8NGX0 322 aa10.35□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 ZPLD1Q8TCW7 415 aa10.35□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 SLC35A4Q96G79 324 aa10.35□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 DHDHQ9UQ10 334 aa10.35□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 LRP12Q9Y561 859 aa10.35□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 GPR89AB7ZAQ6 455 aa10.35□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 NUPR1O60356 82 aa10.35□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 GPR89BP0CG08 455 aa10.35□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 GNB3P16520 340 aa10.35□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 CLEC12BQ2HXU8 276 aa10.35□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 WDR38Q5JTN6 314 aa10.35□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 ASPHD2Q6ICH7 369 aa10.35□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 Q6ZWC4 215 aa10.35□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 ARRDC3Q96B67 414 aa10.35□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 C4orf45Q96LM5 186 aa10.35□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 GPR84Q9NQS5 396 aa10.35□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 SMPXQ9UHP9 88 aa10.35□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 MEGF11A6BM72 1044 aa10.34□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 SLC25A17O43808 307 aa10.34□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 GNG7O60262 68 aa10.34□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 C8orf89P0DMQ9 161 aa10.34□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 TCN2P20062 427 aa10.34□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 CTSSP25774 331 aa10.34□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 ATP6V0CP27449 155 aa10.34□□□□□ -0.75
SPIN3-241ENST00000640511 PSMB5P28074 263 aa10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms