RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637881.1

CDKL5-211, Transcript of cyclin dependent kinase like 5, humanhuman

TSL 5

Gene CDKL5, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5-211ENST00000637881 TMEM212A6NML5 194 aa6.95□□□□□ -1.3
CDKL5-211ENST00000637881 FGF17O60258 216 aa6.95□□□□□ -1.3
CDKL5-211ENST00000637881 B4GALT2O60909 372 aa6.95□□□□□ -1.3
CDKL5-211ENST00000637881 CEACAM1P13688 526 aa6.95□□□□□ -1.3
CDKL5-211ENST00000637881 SLC6A6P31641 620 aa6.95□□□□□ -1.3
CDKL5-211ENST00000637881 MPLP40238 635 aa6.95□□□□□ -1.3
CDKL5-211ENST00000637881 WASP42768 502 aa6.95□□□□□ -1.3
CDKL5-211ENST00000637881 ZNF117Q03924 483 aa6.95□□□□□ -1.3
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CDKL5-211ENST00000637881 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.95□□□□□ -1.3
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CDKL5-211ENST00000637881 FAM213BQ8TBF2 198 aa6.95□□□□□ -1.3
CDKL5-211ENST00000637881 RHBDD1Q8TEB9 315 aa6.95□□□□□ -1.3
CDKL5-211ENST00000637881 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa6.95□□□□□ -1.3
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CDKL5-211ENST00000637881 FAM3CQ92520 227 aa6.95□□□□□ -1.3
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CDKL5-211ENST00000637881 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CDKL5-211ENST00000637881 LRP12Q9Y561 859 aa6.95□□□□□ -1.3
CDKL5-211ENST00000637881 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa6.95□□□□□ -1.3
CDKL5-211ENST00000637881 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.95□□□□□ -1.3
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CDKL5-211ENST00000637881 SELENOVP59797 346 aa6.95□□□□□ -1.3
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CDKL5-211ENST00000637881 SLC17A1Q14916 467 aa6.95□□□□□ -1.3
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CDKL5-211ENST00000637881 OR5B12Q96R08 314 aa6.95□□□□□ -1.3
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CDKL5-211ENST00000637881 OR6C3Q9NZP0 311 aa6.95□□□□□ -1.3
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CDKL5-211ENST00000637881 RNF115Q9Y4L5 304 aa6.95□□□□□ -1.3
CDKL5-211ENST00000637881 OR6C6A6NF89 314 aa6.94□□□□□ -1.3
CDKL5-211ENST00000637881 J3QR06 171 aa6.94□□□□□ -1.3
CDKL5-211ENST00000637881 CORTO00230 105 aa6.94□□□□□ -1.3
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CDKL5-211ENST00000637881 KLK1P06870 262 aa6.94□□□□□ -1.3
CDKL5-211ENST00000637881 CISD3P0C7P0 127 aa6.94□□□□□ -1.3
CDKL5-211ENST00000637881 TCN2P20062 427 aa6.94□□□□□ -1.3
CDKL5-211ENST00000637881 GZMHP20718 246 aa6.94□□□□□ -1.3
CDKL5-211ENST00000637881 S100A7P31151 101 aa6.94□□□□□ -1.3
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CDKL5-211ENST00000637881 FAM90A2PQ658T7 463 aa6.94□□□□□ -1.3
CDKL5-211ENST00000637881 TMEM215Q68D42 235 aa6.94□□□□□ -1.3
CDKL5-211ENST00000637881 AGTRAPQ6RW13 159 aa6.94□□□□□ -1.3
CDKL5-211ENST00000637881 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa6.94□□□□□ -1.3
CDKL5-211ENST00000637881 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.94□□□□□ -1.3
CDKL5-211ENST00000637881 CLDND2Q8NHS1 167 aa6.94□□□□□ -1.3
CDKL5-211ENST00000637881 FAM174AQ8TBP5 190 aa6.94□□□□□ -1.3
CDKL5-211ENST00000637881 TMEM239Q8WW34 195 aa6.94□□□□□ -1.3
CDKL5-211ENST00000637881 TMEM230Q96A57 120 aa6.94□□□□□ -1.3
CDKL5-211ENST00000637881 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CDKL5-211ENST00000637881 LRFN3Q9BTN0 628 aa6.94□□□□□ -1.3
CDKL5-211ENST00000637881 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa6.94□□□□□ -1.3
CDKL5-211ENST00000637881 ALG12Q9BV10 488 aa6.94□□□□□ -1.3
CDKL5-211ENST00000637881 TPSD1Q9BZJ3 242 aa6.94□□□□□ -1.3
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