RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616395.4

TRAPPC3-209, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-209ENST00000616395 GNALP38405 381 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 HTR5AP47898 357 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF81P51508 661 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 INSL4Q14641 139 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 GLT8D1Q68CQ7 371 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 SERPINA12Q8IW75 414 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR5D14Q8NGL3 314 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF799Q96GE5 643 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 CMTM3Q96MX0 182 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 BARHL1Q9BZE3 327 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 COMMD3Q9UBI1 195 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 A0A1W2PPK0 400 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 FAM25AB3EWG3 89 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 FAM25CB3EWG5 89 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 FAM25GB3EWG6 89 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 F5H5K5 113 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 G3V4G9 280 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 PLATP00750 562 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 IGHV1-46P01743 117 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 CD80P33681 288 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 ETV6P41212 452 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 SCAND1P57086 179 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 DEFB112Q30KQ8 113 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 FAM57BQ71RH2 274 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 PGAP1Q75T13 922 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 NKAIN3Q8N8D7 197 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR10S1Q8NGN2 331 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 DIRAS2Q96HU8 199 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR2H1Q9GZK4 316 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 RGCCQ9H4X1 137 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 DAPK2Q9UIK4 370 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 A0A0U1RQV5 110 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 SRRM5B3KS81 715 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 C3orf80F5H4A9 247 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 P2RY10O00398 339 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 MAGEB3O15480 346 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 TBX1O43435 398 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 FSTP19883 344 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 RBMXP38159 391 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 PAX8Q06710 450 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 FAM209AQ5JX71 171 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 FAM27D1Q5T7N8 215 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZDHHC16Q969W1 377 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 C10orf35Q96D05 121 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 WNT5BQ9H1J7 359 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 CDH20Q9HBT6 801 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 DCAF16Q9NXF7 216 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 RNF114Q9Y508 228 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 TRAV40A0A0B4J280 105 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 FABP12A6NFH5 140 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 VGLL3A8MV65 326 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 AIPO00170 330 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 CTDSP2O14595 271 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 IGHV3-13P01766 116 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 IGHV2-70P01814 119 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 TTRP02766 147 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 ACSM4P0C7M7 580 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 CCNOP22674 350 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 TNFSF8P32971 234 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 UCP2P55851 309 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 DEFA1P59665 94 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 DEFA3P59666 94 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 PSG4Q00888 419 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 CEP78Q5JTW2 689 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF774Q6NX45 483 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 FAM131AQ6UXB0 335 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 CCDC190Q86UF4 302 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 DIRC2Q96SL1 478 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 CCDC32Q9BV29 185 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 CHIAQ9BZP6 476 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 ABCB9Q9NP78 766 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 ETV7Q9Y603 341 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 NPTNQ9Y639 398 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 LOC100509620A0A075B734 347 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 SMIM30A4D0T7 59 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 IFITM5A6NNB3 132 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 A8MXK9 166 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 XRCC2O43543 280 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 VSIG8P0DPA2 414 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms