RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610404.4

TTR-204, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTR, Length 1,040 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-204ENST00000610404 OR6K6Q8NGW6 343 aa6.98□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 OR6N2Q8NGY6 317 aa6.98□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 OR2T27Q8NH04 317 aa6.98□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa6.98□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 AQP3Q92482 292 aa6.98□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 MALSU1Q96EH3 234 aa6.98□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 ZNF488Q96MN9 340 aa6.98□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 RGCCQ9H4X1 137 aa6.98□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 ABCB9Q9NP78 766 aa6.98□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 MRGBPQ9NV56 204 aa6.98□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 U3KQK5 164 aa6.98□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 A0A1W2PPE2 198 aa6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 A0A1W2PPH5 198 aa6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 A0A1W2PR64 198 aa6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 A0A1W2PRV1 198 aa6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 FAM90A22PA8MWA6 464 aa6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 APOC1P02654 83 aa6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 CHRM2P08172 466 aa6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 COX4I1P13073 169 aa6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 VAMP1P23763 118 aa6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 RRM2P31350 389 aa6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 SMIM11AP58511 58 aa6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 GNG3P63215 75 aa6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 LSAMPQ13449 338 aa6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 CEP78Q5JTW2 689 aa6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 GLYATQ6IB77 296 aa6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 OR9Q2Q8NGE9 314 aa6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 OR8B12Q8NGG6 310 aa6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 OR4Q3Q8NH05 313 aa6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 CCDC140Q96MF4 163 aa6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 INTS14Q96SY0 518 aa6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 BTBD10Q9BSF8 475 aa6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 CHID1Q9BWS9 393 aa6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 C1orf21Q9H246 121 aa6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 MED20Q9H944 212 aa6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 IL20Q9NYY1 176 aa6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 ABCD2Q9UBJ2 740 aa6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 HILPDAQ9Y5L2 63 aa6.97□□□□□ -1.29
TTR-204ENST00000610404 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 C3orf84H3BNL1 204 aa6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 SLC1A7O00341 560 aa6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 SLC22A2O15244 555 aa6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 CLIC3O95833 236 aa6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 LPLP06858 475 aa6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 H2BFMP0C1H6 154 aa6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 CD24P25063 80 aa6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 PRDX2P32119 198 aa6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 IFNGR2P38484 337 aa6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 ECI1P42126 302 aa6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 NUDT2P50583 147 aa6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 SLC34A1Q06495 639 aa6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 CEACAM21Q3KPI0 293 aa6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 KRT74Q7RTS7 529 aa6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 TCF23Q7RTU1 214 aa6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 CALHM1Q8IU99 346 aa6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 BATF2Q8N1L9 274 aa6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 ZNF561Q8N587 486 aa6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 RNF148Q8N7C7 305 aa6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 POC1AQ8NBT0 407 aa6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 OR4X2Q8NGF9 303 aa6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 OR13D1Q8NGV5 346 aa6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 ZNF671Q8TAW3 534 aa6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 DPF1Q92782 380 aa6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 PYURFQ96I23 114 aa6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 OR8B4Q96RC9 309 aa6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 TSSK6Q9BXA6 273 aa6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 TBC1D23Q9NUY8 699 aa6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 RASL12Q9NYN1 266 aa6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 TAS2R1Q9NYW7 299 aa6.96□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 FAM183AA6NL82 134 aa6.95□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 H0YHG0 523 aa6.95□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 SOX14O95416 240 aa6.95□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 GASTP01350 101 aa6.95□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 TK1P04183 234 aa6.95□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 PGA5P0DJD9 388 aa6.95□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 IGHV1-8P0DP01 117 aa6.95□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 OR12D2P58182 307 aa6.95□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 PSME3P61289 254 aa6.95□□□□□ -1.3
TTR-204ENST00000610404 SMIM21Q3B7S5 101 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.7 ms