RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588340.1

EFTUD2-210, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-210ENST00000588340 UPRTQ96BW1 309 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 HES4Q9HCC6 221 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 ISYNA1Q9NPH2 558 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 TRIM36Q9NQ86 728 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 KAAG1Q9UBP8 84 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 CTSZQ9UBR2 303 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 ENPP5Q9UJA9 477 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF222Q9UK12 451 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 HHLA2Q9UM44 414 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 LRRC42Q9Y546 428 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 A0A1B0GVI7 797 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 ANKRD61A6NGH8 418 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 OOEPA6NGQ2 149 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 A6NLC8 198 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 TRIM64CA6NLI5 447 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 ANXA2P2A6NMY6 339 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF850A8MQ14 1090 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 C22orf46C9J442 243 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 J3QLW9 94 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 ADAM20O43506 726 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 SYT7O43581 403 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 ENSAO43768 121 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 RPP14O95059 124 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 PLATP00750 562 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 NRASP01111 189 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 GYPAP02724 150 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF19P17023 458 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 EGR1P18146 543 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 MYL12AP19105 171 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 FSTP19883 344 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 TAS2R43P59537 309 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 FGF12P61328 243 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 BAMBIQ13145 260 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 TPBGQ13641 420 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 GFOD2Q3B7J2 385 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 CD276Q5ZPR3 534 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 C9orf139Q6ZV77 190 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM90A1Q86YD7 464 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 C3orf56Q8N813 242 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 SCCPDHQ8NBX0 429 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 AQP3Q92482 292 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 SPSB1Q96BD6 273 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 DMRTB1Q96MA1 342 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 DUX5Q96PT3 197 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 NRIP2Q9BQI9 281 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 RTL8AQ9BWD3 113 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 PKIBQ9C010 78 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 DNTTIP1Q9H147 329 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 SMURF1Q9HCE7 757 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 ERVK-18Q9QC07 812 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 PIGLQ9Y2B2 252 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 TRAV40A0A0B4J280 105 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF879B4DU55 563 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 CLDN34H7C241 214 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 J3QT63 122 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 TMPRSS2O15393 492 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 PIN1P1O15428 100 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 GATBO75879 557 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 LIPFP07098 398 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 SFTPBP07988 381 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 PGA5P0DJD9 388 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 HKR1P10072 659 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 MMP9P14780 707 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 GNALP38405 381 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 FUT6P51993 359 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 GP2P55259 537 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 BPIFB3P59826 476 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 ZP1P60852 638 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 IL24Q13007 206 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 MICBQ29980 383 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 AWAT1Q58HT5 328 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 YIF1BQ5BJH7 314 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 GPR157Q5UAW9 335 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 STUMQ69YW2 141 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 ASCL4Q6XD76 172 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 BRD3OSQ6XYD6 125 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF573Q86YE8 665 aa5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 120.8 ms