RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 C20orf24Q9BUV8 137 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 DCHS1Q96JQ0 3298 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 RFPL4AA6NLU0 287 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 SNRPGP15A8MWD9 76 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 GLI4P10075 376 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 FSTP19883 344 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 TNFRSF9Q07011 255 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 SLC9A3R2Q15599 337 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 LYPD6Q86Y78 171 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 BEST3Q8N1M1 668 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 FAM24BQ8N5W8 94 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 BHLHE23Q8NDY6 225 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 LYZL4Q96KX0 146 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 PLEK2Q9NYT0 353 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 CEP250Q9BV73 2442 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 DOCK10Q96BY6 2186 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 MEGF11A6BM72 1044 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 IFITM10A6NMD0 228 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 NPIPA2E9PIF3 369 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 C3orf80F5H4A9 247 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 NPIPA3F8WFD2 350 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 STK17BO94768 372 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 CSNK1A1P48729 337 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 ATP1B3P54709 279 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 TMEM50BP56557 158 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 SRYQ05066 204 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 ARFRP1Q13795 201 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 C1orf100Q5SVJ3 147 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 AGBL5Q8NDL9 886 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 C15orf40Q8WUR7 153 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 PRO3102Q9H379 93 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 TP53I11O14683 189 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 LAMTOR5O43504 91 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 CD34P28906 385 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 SNAI3Q3KNW1 292 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 STOML3Q8TAV4 291 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 GUCD1Q96NT3 240 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 LPAR5Q9H1C0 372 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 RAB22AQ9UL26 194 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 PRR14LQ5THK1 2151 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 CYTIPO60759 359 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 DKK1O94907 266 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 IFNA6P05013 189 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 TCN2P20062 427 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 IL13RA1P78552 427 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 NKAPLQ5M9Q1 402 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 C15orf54Q8N8G6 183 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 OR56B2PQ8NGI1 322 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 OR4A4PQ8NGN8 299 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 DYRK2Q92630 601 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 ZBTB8AQ96BR9 441 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 HRH4Q9H3N8 390 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 AQP7P3A6NL99 342 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 HSPB2A8KAH6 182 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 F5H0A9 414 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 B4GALT1P15291 398 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 ACKR3P25106 362 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 QRFPP83859 136 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 HSPB2Q16082 182 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 TMEM229BQ8NBD8 167 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 OR14L1PQ8NHC6 308 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 AQP3Q92482 292 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 IMMP1LQ96LU5 166 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 IFNA2P01563 188 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 ARG1P05089 322 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 GABRR1P24046 479 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 SSR4P51571 173 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 Q0VFX4 171 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 UBE2V2Q15819 145 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 SLC23A3Q6PIS1 610 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 SPNS3Q6ZMD2 512 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 Q8NFD4 153 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 OR6X1Q8NH79 312 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 NAT6Q93015 286 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 SEC11CQ9BY50 192 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 GPR173Q9NS66 373 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 MGAQ8IWI9 3026 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 A0A1W2PNV4 684 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 OR5H14A6NHG9 310 aa13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms