RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 ASH2LQ9UBL3 628 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 LHFPL6Q9Y693 200 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 ROS1P08922 2347 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 OR14I1A6ND48 311 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 FAM90A10PA6NDY2 464 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 FAM90A18PA6NE21 464 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 FAM90A16PA6NEW6 464 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 OR6C6A6NF89 314 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 FAM90A7PA6NKC0 464 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 FAM90A22PA8MWA6 464 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 FAM90A12PA8MX19 464 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 H0YC42 278 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 TAAR5O14804 337 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 ARPC5O15511 151 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 DHHO43323 396 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 BCL2L11O43521 198 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 SMPD2O60906 423 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 FARS2O95363 451 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 WDPCPO95876 746 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 CST2P09228 141 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 FAM90A15PP0C7V4 464 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 FAM90A13PP0C7W8 464 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 FAM90A14PP0C7W9 464 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 FAM90A24PP0C7X0 464 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 COX6A1P12074 109 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 HLA-DOBP13765 273 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 DTYMKP23919 212 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 TNFSF10P50591 281 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 EFNA3P52797 238 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 EFNB2P52799 333 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 MLF1P58340 268 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 IL13RA1P78552 427 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 FMODQ06828 376 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 ODF4Q2M2E3 257 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 RAET1LQ5VY80 246 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 C11orf87Q6NUJ2 197 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 LINC00696Q6ZRV3 163 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 TMUB2Q71RG4 321 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 ZNF546Q86UE3 836 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 ANGPTL5Q86XS5 388 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 LINC00346Q8IVM7 164 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 STPG2Q8N412 459 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 RPRMLQ8N4K4 120 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 FAM89BQ8N5H3 189 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 KCNRGQ8N5I3 272 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 DTX3Q8N9I9 347 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 CHST4Q8NCG5 386 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 OR9K2Q8NGE7 335 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 OR5M9Q8NGP3 310 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 OR1J2Q8NGS2 313 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 OR5H2Q8NGV7 314 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 OR4K15Q8NH41 348 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 HAS2Q92819 552 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 PERPQ96FX8 193 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 PGAM5Q96HS1 289 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 GPER1Q99527 375 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 GAL3ST1Q99999 423 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 TM2D1Q9BX74 207 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 TMEM185BQ9H7F4 350 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 ZNF160Q9HCG1 818 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 PARPBPQ9NWS1 579 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 RDH8Q9NYR8 311 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 HSF4Q9ULV5 492 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 FLVCR2Q9UPI3 526 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 V9GYS6 101 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 OR5H14A6NHG9 310 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 G3V3Q6 166 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 SMLR1H3BR10 107 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 J3QW42 95 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 XRCC2O43543 280 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 GMFGO60234 142 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 CDC14BO60729 498 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 CRYABP02511 175 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 SERPINA7P05543 415 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 ZNF35P13682 527 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-218ENST00000584243 ENPP1P22413 925 aa6.99□□□□□ -1.29
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