RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
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CTDNEP1-208ENST00000573600 FLVCR2Q9UPI3 526 aa24.93■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZGRF1Q86YA3 2104 aa24.93■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRSS44E7EML9 344 aa24.92■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 M0QYG6 137 aa24.92■■□□□ 1.58
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CTDNEP1-208ENST00000573600 BPIFB2Q8N4F0 458 aa24.92■■□□□ 1.58
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CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM90A7PA6NKC0 464 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM90A22PA8MWA6 464 aa24.91■■□□□ 1.58
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CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM90A15PP0C7V4 464 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM90A13PP0C7W8 464 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM90A14PP0C7W9 464 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM90A24PP0C7X0 464 aa24.91■■□□□ 1.58
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CTDNEP1-208ENST00000573600 C6orf201Q7Z4U5 140 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLAMF9Q96A28 289 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 ST6GAL2Q96JF0 529 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRRT1Q99946 306 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR51J1Q9H342 316 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC2A8Q9NY64 477 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa24.91■■□□□ 1.58
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF718Q3SXZ3 478 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR52W1Q6IF63 320 aa24.9■■□□□ 1.58
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CTDNEP1-208ENST00000573600 MED28Q9H204 178 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 BCL3P20749 454 aa24.89■■□□□ 1.58
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CTDNEP1-208ENST00000573600 NPBWR2P48146 333 aa24.89■■□□□ 1.58
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC6A7Q99884 636 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-208ENST00000573600 VKORC1Q9BQB6 163 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
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CTDNEP1-208ENST00000573600 JKAMPQ9P055 326 aa24.88■■□□□ 1.57
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CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM76BQ5HYJ3 339 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-208ENST00000573600 CD276Q5ZPR3 534 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-208ENST00000573600 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR10AD1Q8NGE0 317 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLK3Q9H4B4 646 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-208ENST00000573600 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM100Q9NV29 134 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-208ENST00000573600 LRP5LA4QPB2 252 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-208ENST00000573600 J3QT63 122 aa24.86■■□□□ 1.57
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