RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566882.5

CCNDBP1-210, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-210ENST00000566882 S100A13Q99584 98 aa8.78□□□□□ -1
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
CCNDBP1-210ENST00000566882 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
CCNDBP1-210ENST00000566882 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa8.78□□□□□ -1
CCNDBP1-210ENST00000566882 LINC00470Q9BZP3 86 aa8.78□□□□□ -1
CCNDBP1-210ENST00000566882 KCNN3Q9UGI6 736 aa8.78□□□□□ -1
CCNDBP1-210ENST00000566882 BSNQ9UPA5 3926 aa8.78□□□□□ -1
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa8.78□□□□□ -1
CCNDBP1-210ENST00000566882 TM4SF5O14894 197 aa8.78□□□□□ -1
CCNDBP1-210ENST00000566882 IL18BPO95998 194 aa8.78□□□□□ -1
CCNDBP1-210ENST00000566882 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
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CCNDBP1-210ENST00000566882 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
CCNDBP1-210ENST00000566882 MEF2DQ14814 521 aa8.78□□□□□ -1
CCNDBP1-210ENST00000566882 TSC22D1Q15714 1073 aa8.78□□□□□ -1
CCNDBP1-210ENST00000566882 NHLRC3Q5JS37 347 aa8.78□□□□□ -1
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CCNDBP1-210ENST00000566882 STEAP2Q8NFT2 490 aa8.78□□□□□ -1
CCNDBP1-210ENST00000566882 WBP1Q96G27 269 aa8.78□□□□□ -1
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q96M66 194 aa8.78□□□□□ -1
CCNDBP1-210ENST00000566882 ACKR4Q9NPB9 350 aa8.78□□□□□ -1
CCNDBP1-210ENST00000566882 PARPBPQ9NWS1 579 aa8.78□□□□□ -1
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CCNDBP1-210ENST00000566882 STARD10Q9Y365 291 aa8.78□□□□□ -1
CCNDBP1-210ENST00000566882 AUP1Q9Y679 476 aa8.78□□□□□ -1
CCNDBP1-210ENST00000566882 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1
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CCNDBP1-210ENST00000566882 F8VWA3 439 aa8.77□□□□□ -1.01
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CCNDBP1-210ENST00000566882 UBBP0CG47 229 aa8.77□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZBTB25P24278 435 aa8.77□□□□□ -1.01
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CCNDBP1-210ENST00000566882 S100A11P31949 105 aa8.77□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 NPBWR2P48146 333 aa8.77□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 SNU13P55769 128 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 RSU1Q15404 277 aa8.77□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 DEFB109BQ30KR1 87 aa8.77□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM74A1Q5RGS3 127 aa8.77□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 MCEMP1Q8IX19 187 aa8.77□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR56B2PQ8NGI1 322 aa8.77□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR13G1Q8NGZ3 307 aa8.77□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 LRRC20Q8TCA0 184 aa8.77□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 BORCS8Q96FH0 119 aa8.77□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 PRRT1Q99946 306 aa8.77□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
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CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC2A8Q9NY64 477 aa8.77□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 ANAPC10Q9UM13 185 aa8.77□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 ESPL1Q14674 2120 aa8.77□□□□□ -1.01
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CCNDBP1-210ENST00000566882 DHODHQ02127 395 aa8.77□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR8B8Q15620 311 aa8.77□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM209BQ5JX69 171 aa8.77□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM65Q6PI78 240 aa8.77□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 COLCA1Q6ZS62 124 aa8.77□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC25A42Q86VD7 318 aa8.77□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR5M9Q8NGP3 310 aa8.77□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 OCSTAMPQ9BR26 566 aa8.77□□□□□ -1.01
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CCNDBP1-210ENST00000566882 WDR13Q9H1Z4 485 aa8.77□□□□□ -1.01
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CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa8.77□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 C9orf170A2RU37 121 aa8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC22A20A6NK97 555 aa8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 RLN2P04090 185 aa8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 CELA3BP08861 270 aa8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPATA46Q5T0L3 261 aa8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q6ZPA2 131 aa8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 KCTD9Q7L273 389 aa8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 HOGA1Q86XE5 327 aa8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 FBXL14Q8N1E6 418 aa8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM230Q96A57 120 aa8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 LINC00052Q96N35 136 aa8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-210ENST00000566882 SULT4A1Q9BR01 284 aa8.76□□□□□ -1.01
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