RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566784.5

PKD1-231, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-231	ENST00000566784	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784		A0A1W2PQ09	198 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	SLC1A7	O00341	560 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	IGHA1	P01876	353 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	MELTF	P08582	738 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	HTR1A	P08908	422 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	PRDX2	P32119	198 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	RAB40B	Q12829	278 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	GALE	Q14376	348 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	UTS2B	Q765I0	119 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	RDH10	Q8IZV5	341 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	SYS1	Q8N2H4	156 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	STMN2	Q93045	179 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	PELI1	Q96FA3	418 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	BORCS8	Q96FH0	119 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	C4orf36	Q96KX1	117 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784		A0A0U1RQK1	487 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784		J3QLW9	94 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	BAG2	O95816	211 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	KNG1	P01042	644 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF19	P17023	458 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	CAPZA1	P52907	286 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	BLMH	Q13867	455 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	TNFRSF14	Q92956	283 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF649	Q9BS31	505 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	ALG8	Q9BVK2	526 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	HHLA2	Q9UM44	414 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	RBP2	P50120	134 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	UBE2E1	P51965	193 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	ATP1B3	P54709	279 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	LPCAT4	Q643R3	524 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	APH1B	Q8WW43	257 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	CEP19	Q96LK0	163 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF747	Q9BV97	191 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	CHIA	Q9BZP6	476 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	AMBN	Q9NP70	447 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	C8orf4	Q9NR00	106 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784		A0A1W2PPH5	198 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	NPFF	O15130	113 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	TK1	P04183	234 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	FBP1	P09467	338 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF20	P17024	532 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	ATF1	P18846	271 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	PRKACB	P22694	351 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	IER3	P46695	156 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	KLHL22	Q53GT1	634 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784		Q8IYB0	196 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	BATF2	Q8N1L9	274 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	SLAMF9	Q96A28	289 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	SPSB1	Q96BD6	273 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	FGGY	Q96C11	551 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	JAM3	Q9BX67	310 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PKD1-231	ENST00000566784	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		11.33	□□□□□ -0.6

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