RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560965.1

CHP1-208, Transcript of calcineurin like EF-hand protein 1, human

TSL 2

Gene CHP1, Length 467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHP1-208	ENST00000560965	SOD3	P08294	240 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	CALCB	P10092	127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	IRF2	P14316	349 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	CA6	P23280	308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	ANOS1	P23352	680 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	HTR2C	P28335	458 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	SOX2	P48431	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	SERPINB10	P48595	397 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	EFNA4	P52798	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF154	Q13106	437 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	KCNJ8	Q15842	424 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	DDI2	Q5TDH0	399 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	ELP2	Q6IA86	826 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	C22orf42	Q6IC83	251 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	ASCL4	Q6XD76	172 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	MOB3C	Q70IA8	216 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	LYPD6	Q86Y78	171 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	OR5AS1	Q8N127	324 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	BVES	Q8NE79	360 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965		Q8NFD4	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	MBD6	Q96DN6	1003 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	RNF170	Q96K19	258 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	OR2V2	Q96R30	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	GPER1	Q99527	375 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	CCL19	Q99731	98 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	SOX7	Q9BT81	388 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	CENPO	Q9BU64	300 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	OR51I2	Q9H344	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	MSL2	Q9HCI7	577 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	ETV7	Q9Y603	341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	TACC2	O95359	2948 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965		A0A0A6YYH2	397 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965		A0A1W2PPR1	153 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	C5orf63	A6NC05	138 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	DPPA5	A6NC42	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	CCDC160	A6NGH7	325 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965		A6NJ64	397 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF732	B4DXR9	585 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	SHOX	O15266	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	AKR7A2	O43488	359 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	NDUFA2	O43678	99 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	KDM4B	O94953	1096 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	MAS1	P04201	325 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	ARSB	P15848	533 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	SDC2	P34741	201 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	PTGFR	P43088	359 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	HAAO	P46952	286 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	GPM6A	P51674	278 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	TMEM33	P57088	247 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	ZP1	P60852	638 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	MAB21L1	Q13394	359 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	ARL6IP1	Q15041	203 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	DGUOK	Q16854	277 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	HFE	Q30201	348 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	CEP78	Q5JTW2	689 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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