RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 H2AFB2P0C5Z0 115 aa15.23■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 SELEP16581 610 aa15.23■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 RCVRNP35243 200 aa15.23■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARFRP1Q13795 201 aa15.23■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 NKAPLQ5M9Q1 402 aa15.23■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 C22orf34Q6ZV56 151 aa15.23■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 SSX8Q7RTT4 187 aa15.23■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 PCNX1Q96RV3 2341 aa15.23■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 IQCF6A8MYZ5 107 aa15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 RAB3DO95716 219 aa15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 BCL3P20749 454 aa15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 FABP6P51161 128 aa15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 GNG3P63215 75 aa15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 SIGIRRQ6IA17 410 aa15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR52W1Q6IF63 320 aa15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 C6orf201Q7Z4U5 140 aa15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 AKAP14Q86UN6 197 aa15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 RADILQ96JH8 1075 aa15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 C20orf85Q9H1P6 137 aa15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 SYNGR1O43759 233 aa15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 DHFRP00374 187 aa15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHRNB4P30926 498 aa15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 PDCD1Q15116 288 aa15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR51S1Q8NGJ8 323 aa15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHAC2Q8WUX2 184 aa15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 DEDD2Q8WXF8 326 aa15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 BEX2Q9BXY8 128 aa15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 BEX1Q9HBH7 125 aa15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 POU2F3Q9UKI9 436 aa15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 ST3GAL6Q9Y274 331 aa15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 NBEAQ8NFP9 2946 aa15.21■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR5B21A6NL26 309 aa15.21■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 CRYAAP02489 173 aa15.21■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 SNU13P55769 128 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF718Q3SXZ3 478 aa15.21■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 ST8SIA4Q92187 359 aa15.21■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 MTCH1Q9NZJ7 389 aa15.21■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 HMX3A6NHT5 357 aa15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 F8VVB4 439 aa15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 F8VWA3 439 aa15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 H0YL77 283 aa15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 CSN2P05814 226 aa15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 ASCL1P50553 236 aa15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 C11orf91Q3C1V1 193 aa15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF573Q86YE8 665 aa15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 MKXQ8IYA7 352 aa15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 SAXO1Q8IYX7 474 aa15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 HS3ST6Q96QI5 342 aa15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 MICU1Q9BPX6 476 aa15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 RTL8AQ9BWD3 113 aa15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 ACACBO00763 2458 aa15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A0A6YYJ9 748 aa15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRAPPC2LH3BP13 241 aa15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 CD74P04233 296 aa15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPP3CBP16298 524 aa15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 KITLGP21583 273 aa15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 GCH1P30793 250 aa15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 RBM11P57052 281 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 NKPD1Q17RQ9 610 aa15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 BRICD5Q6PL45 260 aa15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 FBXW5Q969U6 566 aa15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF488Q96MN9 340 aa15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAAP24Q9BTP7 215 aa15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR51I2Q9H344 312 aa15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPEF1Q9Y4P9 236 aa15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa15.19■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 SERPINE3A8MV23 424 aa15.19■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 A8MV72 311 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 C3orf80F5H4A9 247 aa15.19■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 AKR7A2O43488 359 aa15.19■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCNKO75909 580 aa15.19■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 NDUFB6O95139 128 aa15.19■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 AMY2AP04746 511 aa15.19■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 ADORA2A-AS1P86434 159 aa15.19■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR8G1Q15617 311 aa15.19■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 WDR86Q86TI4 376 aa15.19■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM200AQ86VY9 491 aa15.19■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR8G5Q8NG78 346 aa15.19■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 GINS4Q9BRT9 223 aa15.19■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa15.19■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM100Q9NV29 134 aa15.19■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 COQ3Q9NZJ6 369 aa15.19■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 TPRP12270 2363 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.3 ms