RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559357.5

USP3-AS1-202, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 455 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-202ENST00000559357 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 FABP12A6NFH5 140 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 GGT3PA6NGU5 568 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR5H1A6NKK0 313 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCL21O00585 134 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 MAGEB3O15480 346 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 IGLV3-1P01715 115 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 SERPINA5P05154 406 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 CECR9P0C854 216 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 CBR1P16152 277 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 ACKR3P25106 362 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 HTR2CP28335 458 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 TALDO1P37837 337 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 DDOSTP39656 456 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 CA7P43166 264 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 ERVS71-1P61550 626 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM3AP98173 230 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM27E3Q08E93 113 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 PLA2G7Q13093 441 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 P2RY6Q15077 328 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 ST3GAL2Q16842 350 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 PYDC2Q56P42 97 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 UBE2NLQ5JXB2 153 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 PLCXD3Q63HM9 321 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM211Q6ICI0 200 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 COLCA1Q6ZS62 124 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 MOB3CQ70IA8 216 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 PGAP1Q75T13 922 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 RNF144BQ7Z419 303 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCDC190Q86UF4 302 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 FJX1Q86VR8 437 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCDC36Q8IYA8 594 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF101Q8IZC7 436 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR5AS1Q8N127 324 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 C17orf78Q8N4C9 275 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 NKAIN3Q8N8D7 197 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 BHLHE23Q8NDY6 225 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR4M1Q8NGD0 313 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR51D1Q8NGF3 324 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR56B2PQ8NGI1 322 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR52N4Q8NGI2 321 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR5D18Q8NGL1 313 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR1J1Q8NGS3 322 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 PIGCQ92535 297 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF75AQ96N20 296 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 WDFY2Q96P53 400 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 ACTR6Q9GZN1 396 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 HIPK2Q9H2X6 1198 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 PIGMQ9H3S5 423 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 NEK6Q9HC98 313 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 ABRACLQ9P1F3 81 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR5V1Q9UGF6 321 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 AMDHD2Q9Y303 409 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 MEMO1Q9Y316 297 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 V9GYH0 126 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZGRF1Q86YA3 2104 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 SHANK1Q9Y566 2161 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 A0A0G2JMP0 313 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 A0A0X1KG70 313 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF850A8MQ14 1090 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 A8MXE2 369 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC17A2O00624 439 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 SMPD2O60906 423 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 NRASP01111 189 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 FGF2P09038 288 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 CALCBP10092 127 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 CALCRP30988 508 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR3A4PP47883 348 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 POU3F4P49335 361 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 EVX1P49640 407 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 PSMD7P51665 324 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 EFNB2P52799 333 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 PPP5CP53041 499 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 PPP1CBP62140 327 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF45Q02386 682 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 TNK1Q13470 666 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 PPA1Q15181 289 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 TAB1Q15750 504 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 UBE2V2Q15819 145 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF79Q15937 498 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 C2orf76Q3KRA6 126 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-AS1-202ENST00000559357 CLVS2Q5SYC1 327 aa4.66□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms