RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555668.5

GPHN-210, Transcript of gephyrin, humanhuman

TSL 4

Gene GPHN, Length 550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHN-210ENST00000555668 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 PSG8Q9UQ74 426 aa3.56□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 FUT9Q9Y231 359 aa3.56□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 RCE1Q9Y256 329 aa3.56□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa3.56□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa3.56□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 NTNG1Q9Y2I2 539 aa3.56□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 WIPI2Q9Y4P8 454 aa3.56□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa3.56□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 NHSQ6T4R5 1651 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 A0A1B0GTI1 187 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 TMEM233B4DJY2 109 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 H7BYZ3 331 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 DCTN6O00399 190 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 XKRYO14609 159 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 MPPED1O15442 326 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 DUX1O43812 170 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 TMPRSS11DO60235 418 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 KLK8O60259 260 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 C1QL1O75973 258 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 TMEM50AO95807 157 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 GPANK1O95872 356 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 CD160O95971 181 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 HAND1O96004 215 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 VIPP01282 170 aa3.55□□□□□ -1.84
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GPHN-210ENST00000555668 TYMSP04818 313 aa3.55□□□□□ -1.84
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GPHN-210ENST00000555668 CTSLP07711 333 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 IL3P08700 152 aa3.55□□□□□ -1.84
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GPHN-210ENST00000555668 SBK3P0C264 359 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 CTSEP14091 401 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 GCSHP23434 173 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 ACP1P24666 158 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 HTR1FP30939 366 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 ARL2P36404 184 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 MDH2P40926 338 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 GNG4P50150 75 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 TAS2R30P59541 319 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 PAFAH1B2P68402 229 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 DMWDQ09019 674 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 MGAT2Q10469 447 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 PMS2P11Q13670 270 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 GINS1Q14691 196 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 GNMTQ14749 295 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 RGNQ15493 299 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 CCSMST1Q4G0I0 132 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 TMEM128Q5BJH2 165 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 PAGE3Q5JUK9 113 aa3.55□□□□□ -1.84
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GPHN-210ENST00000555668 ZNF534Q76KX8 674 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 FA2HQ7L5A8 372 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 SLC16A9Q7RTY1 509 aa3.55□□□□□ -1.84
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GPHN-210ENST00000555668 ACOT1Q86TX2 421 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 CALHM3Q86XJ0 350 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 MARCH9Q86YJ5 346 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 RNF175Q8N4F7 328 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
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GPHN-210ENST00000555668 CSNK1A1LQ8N752 337 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 TCEANCQ8N8B7 351 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 ACOT4Q8N9L9 421 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 NPEPL1Q8NDH3 523 aa3.55□□□□□ -1.84
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GPHN-210ENST00000555668 OR4N2Q8NGD1 307 aa3.55□□□□□ -1.84
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GPHN-210ENST00000555668 PPP1R35Q8TAP8 253 aa3.55□□□□□ -1.84
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GPHN-210ENST00000555668 DOK4Q8TEW6 326 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 SECTM1Q8WVN6 248 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 PSMF1Q92530 271 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 SLAMF6Q96DU3 332 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 SEH1LQ96EE3 360 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 Q96MF0 132 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 DUX5Q96PT3 197 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 ACCSQ96QU6 501 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 SLC39A8Q9C0K1 460 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 SLC25A51Q9H1U9 297 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 WDR13Q9H1Z4 485 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa3.55□□□□□ -1.84
GPHN-210ENST00000555668 C1orf198Q9H425 327 aa3.55□□□□□ -1.84
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