RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 ZNF75AQ96N20 296 aa6.34□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.34□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 ABHD6Q9BV23 337 aa6.34□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 BARHL1Q9BZE3 327 aa6.34□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 GCM1Q9NP62 436 aa6.34□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 LAMP5Q9UJQ1 280 aa6.34□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 A0A1W2PRX2 142 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 B4DSR2 109 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 SULT1B1O43704 296 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 ANGPTL7O43827 346 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 FCER2P06734 321 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 PMELP40967 661 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 BTN1A1Q13410 526 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 IGSF11Q5DX21 431 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 GLYATL3Q5SZD4 288 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 NHLRC1Q6VVB1 395 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 FAM122BQ7Z309 247 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 LRRC29Q8WV35 223 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 CDCA4Q9BXL8 241 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 MIXL1Q9H2W2 232 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 ZNF665Q9H7R5 613 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 MED9Q9NWA0 146 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 KIF25Q9UIL4 384 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 A0A1W2PRQ8 180 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 FAM181BA6NEQ2 426 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 FABP12A6NFH5 140 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 SMLR1H3BR10 107 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 HNF1AP20823 631 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 MMP15P51511 669 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 RPS23P62266 143 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 MALLQ13021 153 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 HNF4GQ14541 408 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 C12orf54Q6X4T0 127 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 MOB3CQ70IA8 216 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 RNF144BQ7Z419 303 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 PRR18Q8N4B5 295 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 SCCPDHQ8NBX0 429 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 MGLLQ99685 303 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 LINC00470Q9BZP3 86 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 EVA1AQ9H8M9 152 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 ELOVL3Q9HB03 270 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 IL36RNQ9UBH0 155 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 SESN1Q9Y6P5 492 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 CD5LO43866 347 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 PRKYO43930 277 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 S100A6P06703 90 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 EGR1P18146 543 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 TNFSF4P23510 183 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 FGF12P61328 243 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 LMO4P61968 165 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 COX10Q12887 443 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 PYDC2Q56P42 97 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 ZNF600Q6ZNG1 722 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 GLCCI1Q86VQ1 547 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 LRRC75AQ8NAA5 344 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 SLITRK2Q9H156 845 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 COPS3Q9UNS2 423 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 KRBOX1C9JBD0 128 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 FABP7O15540 132 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 GMDSO60547 372 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 SEMG1P04279 462 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 ZNF3P17036 446 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 ACKR3P25106 362 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 SSX1Q16384 188 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 HSD17B12Q53GQ0 312 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 TRIQKQ629K1 86 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 FAM185AQ8N0U4 392 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 KIR3DL3Q8N743 410 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 OR2T4Q8NH00 348 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 REEP6Q96HR9 211 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 LRR1Q96L50 414 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 WACQ9BTA9 647 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 DCTN5Q9BTE1 182 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 C1orf198Q9H425 327 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 ESM1Q9NQ30 184 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 ZNRD1Q9P1U0 126 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-212ENST00000548567 MGAT4AQ9UM21 535 aa6.32□□□□□ -1.4
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