RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529454.5

RPS6KA1-215, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A1, human

TSL 5

Gene RPS6KA1, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS6KA1-215	ENST00000529454	ZNF273	Q14593	569 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RPS6KA1-215	ENST00000529454	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
RPS6KA1-215	ENST00000529454	KRT74	Q7RTS7	529 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RPS6KA1-215	ENST00000529454	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RPS6KA1-215	ENST00000529454	SPATA24	Q86W54	205 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RPS6KA1-215	ENST00000529454	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RPS6KA1-215	ENST00000529454	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RPS6KA1-215	ENST00000529454	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RPS6KA1-215	ENST00000529454	THTPA	Q9BU02	230 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RPS6KA1-215	ENST00000529454	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RPS6KA1-215	ENST00000529454	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RPS6KA1-215	ENST00000529454	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RPS6KA1-215	ENST00000529454	TCF19	Q9Y242	345 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RPS6KA1-215	ENST00000529454	AQP12B	A6NM10	295 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	F2RL2	O00254	374 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	SSX2	Q16385	188 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	TMEM219	Q86XT9	240 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	MALSU1	Q96EH3	234 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	AJUBA	Q96IF1	538 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	OR5M11	Q96RB7	305 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	ZNF702P	Q9H963	129 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	VGLL3	A8MV65	326 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	FAM107A	O95990	144 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	TTR	P02766	147 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	CHRM2	P08172	466 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	ZNF728	P0DKX0	622 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	CD28	P10747	220 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	RAB13	P51153	203 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	CRISP1	P54107	249 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	CXCR4	P61073	352 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	COL10A1	Q03692	680 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	NDNF	Q8TB73	568 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	MNT	Q99583	582 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	ADI1	Q9BV57	179 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	COPS3	Q9UNS2	423 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454		R4GMQ9	66 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	CCDC182	A6NF36	153 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454		A6NIN4	97 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	C17orf98	A8MV24	154 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454		K7N7A8	449 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	IGLV3-1	P01715	115 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	RBP4	P02753	201 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	LOXL3	P58215	753 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	SLC34A1	Q06495	639 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	FLOT2	Q14254	428 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	EDDM3A	Q14507	147 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454		Q6ZPA2	131 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	ZNF714	Q96N38	554 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	APOL4	Q9BPW4	351 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	PKIB	Q9C010	78 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	MMP28	Q9H239	520 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454		V9GYS6	101 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	hADV38S2	A0JD32	116 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454		A6NDX4	124 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	INMT	O95050	263 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	CYB5A	P00167	134 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	SERPINA3	P01011	423 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	KRT8	P05787	483 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	PF4V1	P10720	104 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	CD33	P20138	364 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	IL24	Q13007	206 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	ODF4	Q2M2E3	257 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPS6KA1-215	ENST00000529454	TMEM42	Q69YG0	159 aa		11.74	□□□□□ -0.53

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