RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512656.1

USP46-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

TSL 3

Gene USP46, Length 467 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-208ENST00000512656 LRP12Q9Y561 859 aa5.86□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa5.86□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 AQP12BA6NM10 295 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 ZNF732B4DXR9 585 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 SLC1A7O00341 560 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 PSG2P11465 335 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 OSMP13725 252 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 ANXA8P13928 327 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 CALB2P22676 271 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 KIR2DS4P43632 304 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 LGALS4P56470 323 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 ACTR3P61158 418 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 RPL31P62899 125 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 MS4A2Q01362 244 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 HERPUD1Q15011 391 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 CEP78Q5JTW2 689 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 ZNF684Q5T5D7 378 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 LCN1P1Q5VSP4 162 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 PLCXD3Q63HM9 321 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 KRT74Q7RTS7 529 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 ZNF573Q86YE8 665 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 CPOQ8IVL8 374 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 AQP12AQ8IXF9 295 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 FAM185AQ8N0U4 392 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 ZNF561Q8N587 486 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 OR5K1Q8NHB7 308 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 OR2T6Q8NHC8 308 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 HPSE2Q8WWQ2 592 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 ASB17Q8WXJ9 295 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 CLPTM1LQ96KA5 538 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 LYZL4Q96KX0 146 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 SSX3Q99909 188 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 PRRG3Q9BZD7 231 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 OR51I2Q9H344 312 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 ENPP5Q9UJA9 477 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 MAB21L2Q9Y586 359 aa5.85□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 RHBDL1O75783 438 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 NXPH2O95156 264 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 NRASP01111 189 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 PRDX2P32119 198 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 RIDAP52758 137 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 CDK5Q00535 292 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 ROM1Q03395 351 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 APOFQ13790 326 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 SNAPC1Q16533 368 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 LY6EQ16553 131 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 CLVS2Q5SYC1 327 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 ACP7Q6ZNF0 438 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 MOB3CQ70IA8 216 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 CALHM1Q8IU99 346 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 ZNF679Q8IYX0 411 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 ADGRG5Q8IZF4 528 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 PNKDQ8N490 385 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 POC1AQ8NBT0 407 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 ZNRF1Q8ND25 227 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 OR51E1Q8TCB6 317 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 DNAJC9Q8WXX5 260 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 AQP3Q92482 292 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 MNTQ99583 582 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 CDCA4Q9BXL8 241 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 PBOV1Q9GZY1 135 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 MEGF9Q9H1U4 602 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 C1orf21Q9H246 121 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 MOB1AQ9H8S9 216 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 SLC25A19Q9HC21 320 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 GPR84Q9NQS5 396 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 FAM206AQ9NX38 181 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 DNAJB9Q9UBS3 223 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 ZNF222Q9UK12 451 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 IKZF2Q9UKS7 526 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 PIGLQ9Y2B2 252 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa5.84□□□□□ -1.47
USP46-208ENST00000512656 RFPL4AA6NLU0 287 aa5.83□□□□□ -1.48
USP46-208ENST00000512656 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa5.83□□□□□ -1.48
USP46-208ENST00000512656 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa5.83□□□□□ -1.48
USP46-208ENST00000512656 H3BUI4 141 aa5.83□□□□□ -1.48
USP46-208ENST00000512656 J3QT63 122 aa5.83□□□□□ -1.48
USP46-208ENST00000512656 DLGAP1O14490 977 aa5.83□□□□□ -1.48
USP46-208ENST00000512656 DHRS3O75911 302 aa5.83□□□□□ -1.48
USP46-208ENST00000512656 OPN1MWP04001 364 aa5.83□□□□□ -1.48
USP46-208ENST00000512656 TFF1P04155 84 aa5.83□□□□□ -1.48
USP46-208ENST00000512656 PGA5P0DJD9 388 aa5.83□□□□□ -1.48
USP46-208ENST00000512656 OPN1MW2P0DN77 364 aa5.83□□□□□ -1.48
USP46-208ENST00000512656 OPN1MW3P0DN78 364 aa5.83□□□□□ -1.48
USP46-208ENST00000512656 FAHP16930 419 aa5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.1 ms