RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	LRP5L	A4QPB2	252 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	C17orf51	A8MQB3	221 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	SIGLEC5	O15389	551 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	B3GALNT1	O75752	331 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	IL11	P20809	199 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	CASP6	P55212	293 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	GGTLC2	Q14390	218 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	OR2T2	Q6IF00	324 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF561	Q8N587	486 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	OR10D3	Q8NH80	312 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1W2PP11	408 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1W2PPC1	479 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM218	A2RU14	115 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	CYB5B	O43169	146 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	PDCD6	O75340	191 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	UPK3A	O75631	287 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	RAC1	P63000	192 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ACER2	Q5QJU3	275 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	D2HGDH	Q8N465	521 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	OR4F5	Q8NH21	305 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	POC1B	Q8TC44	478 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	MITD1	Q8WV92	249 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	OR4F4	Q96R69	305 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	GPR160	Q9UJ42	338 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ESPL1	Q14674	2120 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1W2PR80	420 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	TRIM64B	A6NI03	449 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	MASP2	O00187	686 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ADAM10	O14672	748 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	CCL4	P13236	92 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	TLE1	Q04724	770 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF721	Q8TF20	911 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	PECR	Q9BY49	303 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ADAM20	O43506	726 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ADRA2A	P08913	450 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	NMB	P08949	121 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	MLF1	P58340	268 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	SMIM10	Q96HG1	83 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	MFRP	Q9BY79	579 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	AICDA	Q9GZX7	198 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	NAA60	Q9H7X0	242 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		7.12	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	TTR	P02766	147 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	OR8U8	P0C7N1	319 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	FCAR	P24071	287 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	SLC35G3	Q8N808	338 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	RFESD	Q8TAC1	157 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	TVP23C	Q96ET8	276 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	AP1S3	Q96PC3	154 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	RASL12	Q9NYN1	266 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	VSIG4	Q9Y279	399 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	OTOF	Q9HC10	1997 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	DAO	P14920	347 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	NDUFB7	P17568	137 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	IL11RA	Q14626	422 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	BAGE3	Q86Y29	109 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	BAGE2	Q86Y30	109 aa		7.11	□□□□□ -1.27

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