RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		5.91	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		5.91	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		5.91	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	PATE1	Q8WXA2	126 aa		5.91	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		5.91	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	TOMM40L	Q969M1	308 aa		5.91	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	MOB3A	Q96BX8	217 aa		5.91	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	PPCDC	Q96CD2	204 aa		5.91	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	REEP6	Q96HR9	211 aa		5.91	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	C20orf173	Q96LM9	149 aa		5.91	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	F2RL3	Q96RI0	385 aa		5.91	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	FOXB1	Q99853	325 aa		5.91	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	EBPL	Q9BY08	206 aa		5.91	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		5.91	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	CHST5	Q9GZS9	411 aa		5.91	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		5.91	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	LANCL2	Q9NS86	450 aa		5.91	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		5.91	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	SCN3B	Q9NY72	215 aa		5.91	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		5.91	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		5.91	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	MYOT	Q9UBF9	498 aa		5.91	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		5.91	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		5.91	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	CIB4	A0PJX0	185 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM72	A0PK05	275 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	C1orf226	A1L170	272 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	CDHR4	A6H8M9	788 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	CLDN24	A6NM45	220 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC1A7	O00341	560 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	CHST1	O43916	411 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	SEMA7A	O75326	666 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	IFI6	P09912	130 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	GGT1	P19440	569 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	CFP	P27918	469 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	S100A7	P31151	101 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	GZMM	P51124	257 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	CDH12	P55289	794 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	DLX6	P56179	175 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	CLRN1	P58418	232 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	TAS2R50	P59544	299 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	SELENOW	P63302	87 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF415	Q09FC8	603 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	C1orf61	Q13536	156 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	PMVK	Q15126	192 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	RHEB	Q15382	184 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	HIST3H3	Q16695	136 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	PLK5	Q496M5	336 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	CCDC190	Q86UF4	302 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	DEFB119	Q8N690	84 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	OR2T12	Q8NG77	320 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	LMX1A	Q8TE12	382 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	ISOC1	Q96CN7	298 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	SEH1L	Q96EE3	360 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	OR10C1	Q96KK4	312 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	MBOAT4	Q96T53	435 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	AICDA	Q9GZX7	198 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	MED29	Q9NX70	200 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	NLK	Q9UBE8	527 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FBXO38-208	ENST00000504971	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	5.89	□□□□□ -1.47
FBXO38-208	ENST00000504971	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		5.89	□□□□□ -1.47
FBXO38-208	ENST00000504971	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		5.89	□□□□□ -1.47
FBXO38-208	ENST00000504971	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		5.89	□□□□□ -1.47
FBXO38-208	ENST00000504971	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		5.89	□□□□□ -1.47

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms