RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	C4orf47	A7E2U8	309 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	ANGPTL7	O43827	346 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	GABRA3	P34903	492 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	CAPZB	P47756	277 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC6A8	P48029	635 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	RND2	P52198	227 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	PDX1	P52945	283 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	SOX8	P57073	446 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZG16B	Q96DA0	208 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	P2RX4	Q99571	388 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	PDF	Q9HBH1	243 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLPP1	O14494	284 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	MEP1B	Q16820	701 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	PPTC7	Q8NI37	304 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	DPF1	Q92782	380 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR10A5	Q9H207	317 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	SBF1	O95248	1867 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF728	P0DKX0	622 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	ASCL1	P50553	236 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	CSRP2	Q16527	193 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	HLA-B	Q31612	363 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLD4	Q96BZ4	506 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	SIGMAR1	Q99720	223 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPR132	Q9UNW8	380 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	BRCA2	P51587	3418 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC25A17	O43808	307 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	CTSV	O60911	334 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLCO2B1	O94956	709 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	NUDT14	O95848	222 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	PSG1	P11464	419 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	PAX1	P15863	534 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	D2HGDH	Q8N465	521 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPR35	Q9HC97	309 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549		M0R296	226 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	NPIPB7	O75200	414 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	NTN1	O95631	604 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF43	P17038	809 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	LCN2	P80188	198 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	FUT5	Q11128	374 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	AMZ2	Q86W34	360 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	ERGIC1	Q969X5	290 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF253	O75346	499 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	NPPB	P16860	134 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPR1	P46091	355 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	HBG1	P69891	147 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	HBG2	P69892	147 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	CSNK1G2	P78368	415 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	PAX2	Q02962	417 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25

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