RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 RENP00797 406 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF84P51523 738 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 TMPRSS3P57727 454 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 RAC3P60763 192 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 H3F3AP84243 136 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 GGTLC2Q14390 218 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ODF4Q2M2E3 257 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 AWAT1Q58HT5 328 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 OLFML2AQ68BL7 652 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2A2Q6IF42 318 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 GGNQ86UU5 652 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM24BQ8N5W8 94 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2AK2Q8NG84 335 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2V1Q8NHB1 315 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 CCDC107Q8WV48 283 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 RNFT2Q96EX2 444 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 OXGR1Q96P68 337 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM231Q9H6L2 316 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 RHOFQ9HBH0 211 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 GSKIPQ9P0R6 139 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 CAMK2AQ9UQM7 478 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A0J9YW62 118 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 VSTM5A8MXK1 200 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 NPIPA5E9PKD4 350 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 C11orf98E9PRG8 122 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 XKRYO14609 159 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ADAP1O75689 374 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 IL18BPO95998 194 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 CD5P06127 495 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 SOD3P08294 240 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 OR5AC1P0C628 307 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 STAG3L3P0CL85 134 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 GZMBP10144 247 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 FABP4P15090 132 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 MAGEA5P43359 124 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 PRRX1P54821 245 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 DGCR2P98153 550 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 HSF1Q00613 529 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ACKR1Q16570 336 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 GLT8D1Q68CQ7 371 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 LEG1Q6P5S2 330 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 VWA1Q6PCB0 445 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 UEVLDQ8IX04 471 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 SAMD12Q8N8I0 201 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 EXD3Q8N9H8 876 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 OR4F15Q8NGB8 312 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 OR52I1Q8NGK6 324 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 OR8U1Q8NH10 309 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 OR4K13Q8NH42 304 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 SMIM4Q8WVI0 70 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ASB10Q8WXI3 467 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 RASD2Q96D21 266 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF75AQ96N20 296 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 YPEL4Q96NS1 127 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 RNF2Q99496 336 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 FN3KRPQ9HA64 309 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 INPP5EQ9NRR6 644 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 NPIPA1Q9UND3 350 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 TNFSF18Q9UNG2 199 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM183AA6NL82 134 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM166BA8MTA8 275 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 GABRPO00591 440 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 GOSR2O14653 212 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 FBXO24O75426 580 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHG3P01860 377 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHA1P01876 353 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 HLA-GP17693 338 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ACVR1BP36896 505 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 RPS10P46783 165 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 LHX2P50458 406 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 H2BFSP57053 126 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 OR10A3P58181 314 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ARF6P62330 175 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 NAAAQ02083 359 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 MEF2DQ14814 521 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC22A25Q6T423 547 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 Q6ZS92 163 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC35D2Q76EJ3 337 aa6.34□□□□□ -1.39
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