RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491581.5

HDAC3-211, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-211ENST00000491581 ELMOD2Q8IZ81 293 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 CMTM4Q8IZR5 234 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 YIPF7Q8N8F6 280 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 OR52N4Q8NGI2 321 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 OR5A2Q8NGI9 324 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 OR2T27Q8NH04 317 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM163Q8TC26 289 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 RFT1Q96AA3 541 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 SDSLQ96GA7 329 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 MED30Q96HR3 178 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 SPACA5Q96QH8 159 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 OR5M11Q96RB7 305 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 NRIP2Q9BQI9 281 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 CHST6Q9GZX3 395 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 DPAGT1Q9H3H5 408 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 RIBC2Q9H4K1 309 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 ENPP5Q9UJA9 477 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 MGAM2Q2M2H8 2515 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 OR5B21A6NL26 309 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 J3QT63 122 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 M0R1W7 72 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 TSPAN9O75954 239 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 TK1P04183 234 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 VSIG10L2P0DP72 767 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 CD24P25063 80 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ERVK11-1P61568 191 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 RPL31P62899 125 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 BNIP1Q12981 228 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 EDDM3AQ14507 147 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 CLVS2Q5SYC1 327 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 LCN1P1Q5VSP4 162 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 NXNL2Q5VZ03 156 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 KRT74Q7RTS7 529 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 CATSPERDQ86XM0 798 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 FTMTQ8N4E7 242 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 BEND2Q8NDZ0 799 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 OR10H4Q8NGA5 316 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 EME1Q96AY2 570 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 CYYR1Q96J86 154 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 DNTTIP1Q9H147 329 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 C16orf95Q9H693 158 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 HES4Q9HCC6 221 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 CLN6Q9NWW5 311 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ING3Q9NXR8 418 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 OAZ3Q9UMX2 235 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 SLC22A31A6NKX4 558 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 PSPNO60542 156 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF737O75373 536 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF254O75437 659 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 CD28P10747 220 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 BCL3P20749 454 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 GDNFP39905 211 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 EFNB2P52799 333 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 EDDM3BP56851 147 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 GUCA2AQ02747 115 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 GK3PQ14409 553 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 SSX2Q16385 188 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ZBTB37Q5TC79 503 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 DEGS2Q6QHC5 323 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 SLC25A26Q70HW3 274 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 KLHDC1Q8N7A1 406 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 OR51A4Q8NGJ6 313 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF671Q8TAW3 534 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 PYDC1Q8WXC3 89 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 MMP27Q9H306 513 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF702PQ9H963 129 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 GNG8Q9UK08 70 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 AP4S1Q9Y587 144 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 A0A1B0GUS0 222 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa7.19□□□□□ -1.26
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HDAC3-211ENST00000491581 M0QZ24 198 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 DLGAP1O14490 977 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 GPR37O15354 613 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 IGKV1D-12P01611 117 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ARG1P05089 322 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 CCL1P22362 96 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 MPZP25189 248 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 GABRA5P31644 462 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 POU3F4P49335 361 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 OR12D2P58182 307 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 BLCAPP62952 87 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 FAM189A2Q15884 450 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 SMIM21Q3B7S5 101 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 C1orf146Q5VVC0 180 aa7.19□□□□□ -1.26
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