RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 BEND2Q8NDZ0 799 aa22.66■■□□□ 1.22
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HOXB3-211ENST00000490677 PKIBQ9C010 78 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXB3-211ENST00000490677 RIBC2Q9H4K1 309 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXB3-211ENST00000490677 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa22.66■■□□□ 1.22
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HOXB3-211ENST00000490677 SAC3D1A6NKF1 404 aa22.65■■□□□ 1.22
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HOXB3-211ENST00000490677 F8VWA3 439 aa22.65■■□□□ 1.22
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HOXB3-211ENST00000490677 OR5R1Q8NH85 324 aa22.63■■□□□ 1.21
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HOXB3-211ENST00000490677 PYDC1Q8WXC3 89 aa22.62■■□□□ 1.21
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HOXB3-211ENST00000490677 SLC25A30Q5SVS4 291 aa22.59■■□□□ 1.21
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HOXB3-211ENST00000490677 RFKQ969G6 155 aa22.59■■□□□ 1.21
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HOXB3-211ENST00000490677 SLC35E4Q6ICL7 350 aa22.58■■□□□ 1.21
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HOXB3-211ENST00000490677 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.214e-6■□□□□ 10.9
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HOXB3-211ENST00000490677 TGP01266 2768 aa22.58■■□□□ 1.2
HOXB3-211ENST00000490677 CIB2O75838 187 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-211ENST00000490677 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-211ENST00000490677 AANATQ16613 207 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-211ENST00000490677 FDX2Q6P4F2 183 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-211ENST00000490677 OR2G2Q8NGZ5 317 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-211ENST00000490677 SLAMF9Q96A28 289 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-211ENST00000490677 C10orf35Q96D05 121 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-211ENST00000490677 PPA2Q9H2U2 334 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-211ENST00000490677 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM82A0PJX8 343 aa22.56■■□□□ 1.2
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