RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478693.1

SRRT-211, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 655 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-211ENST00000478693 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa9.51□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 A0A087WXM4 84 aa9.51□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa9.51□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 OR2AT4A6NND4 320 aa9.51□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 F5H0A9 414 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 CCRL2O00421 344 aa9.51□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 ANGPTL7O43827 346 aa9.51□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 ALX3O95076 343 aa9.51□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 PCMT1P22061 227 aa9.51□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 GABRA5P31644 462 aa9.51□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 CAPZA1P52907 286 aa9.51□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 PDZK1IP1Q13113 114 aa9.51□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 IKZF1Q13422 519 aa9.51□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 INSL4Q14641 139 aa9.51□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 HSD17B12Q53GQ0 312 aa9.51□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 UBE2UQ5VVX9 321 aa9.51□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 LYPD2Q6UXB3 125 aa9.51□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 Q8IYB0 196 aa9.51□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 OR52N4Q8NGI2 321 aa9.51□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 ST8SIA4Q92187 359 aa9.51□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 CCL13Q99616 98 aa9.51□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 NRIP2Q9BQI9 281 aa9.51□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 FOXJ3Q9UPW0 622 aa9.51□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 DYSFO75923 2080 aa9.51□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 A8MV72 311 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 GABRPO00591 440 aa9.5□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 NDUFB3O43676 98 aa9.5□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 ARL6IP5O75915 188 aa9.5□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 TFF1P04155 84 aa9.5□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 ALDOBP05062 364 aa9.5□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 WNT2P09544 360 aa9.5□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 CALCBP10092 127 aa9.5□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 PRKACAP17612 351 aa9.5□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 BCL3P20749 454 aa9.5□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 FAM27D1Q5T7N8 215 aa9.5□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 STUMQ69YW2 141 aa9.5□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 ASPHD2Q6ICH7 369 aa9.5□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 FAM216BQ8N7L0 139 aa9.5□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 NKAIN3Q8N8D7 197 aa9.5□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 TMEM185AQ8NFB2 350 aa9.5□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 HIF1ANQ9NWT6 349 aa9.5□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 NDUFB11Q9NX14 153 aa9.5□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 MTCH1Q9NZJ7 389 aa9.5□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 CTSZQ9UBR2 303 aa9.5□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 GLS2Q9UI32 602 aa9.5□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 TRAV20A0A0B4J274 112 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 A0A1B0GW55 424 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 MAGEA13PA6NCF6 341 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 RFPL4AA6NLU0 287 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 KNG1P01042 644 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 DUX4L2P0CJ85 424 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 DUX4L3P0CJ86 424 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 DUX4L4P0CJ87 422 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 DUX4L5P0CJ88 424 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 DUX4L6P0CJ89 424 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 DUX4L7P0CJ90 424 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 PSG2P11465 335 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 NDUFB7P17568 137 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 CPT2P23786 658 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 MYL9P24844 172 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 OR3A4PP47883 348 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 NPY4RP50391 375 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 IL13RA1P78552 427 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 FABP5Q01469 135 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 KRTAP1-1Q07627 177 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 RSU1Q15404 277 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 SSX1Q16384 188 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 LRRC10Q5BKY1 277 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 DCAF12L2Q5VW00 463 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 AWAT2Q6E213 333 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 ZNF529Q6P280 563 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 RNF144BQ7Z419 303 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 FAM58AQ8N1B3 248 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 MUL1Q969V5 352 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 TMEM186Q96B77 213 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 MED30Q96HR3 178 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 METTL9Q9H1A3 318 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 ZNF696Q9H7X3 374 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 DUX4Q9UBX2 424 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 ING4Q9UNL4 249 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 ARID1AO14497 2285 aa9.49□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 AKAP9Q99996 3911 aa9.48□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 A0A0G2JMP0 313 aa9.48□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 A0A0X1KG70 313 aa9.48□□□□□ -0.89
SRRT-211ENST00000478693 A8MXK9 166 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms