RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 HOXA6P31267 233 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 PRSS3P35030 304 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 LGALS7P47929 136 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 PSG7Q13046 419 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 FADDQ13158 208 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 TBC1D28Q2M2D7 210 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 COX19Q49B96 90 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 MPV17L2Q567V2 206 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 PCP2Q8IVA1 136 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 C17orf50Q8WW18 174 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2A5Q96R48 311 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 FAAP24Q9BTP7 215 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 IL20Q9NYY1 176 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 MAP3K5Q99683 1374 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 SMIM23A6NLE4 172 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2AT4A6NND4 320 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 EFCAB9A8MZ26 197 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 F5H5K5 113 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 HAT1O14929 419 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 SPAG7O75391 227 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP5HO75947 161 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 SERPINA6P08185 405 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHV1-8P0DP01 117 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 GRPRP30550 384 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 ACTR1BP42025 376 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 ACOT2P49753 483 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 HBG1P69891 147 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 HBG2P69892 147 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 CCL15Q16663 113 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 DNAL1Q4LDG9 190 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 PDZD11Q5EBL8 140 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 CALHM1Q8IU99 346 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF645Q8N7E2 425 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 S100PBPQ96BU1 408 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 PPP1R14BQ96C90 147 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 CHMP6Q96FZ7 201 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 MBOAT7Q96N66 472 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 SPACA5Q96QH8 159 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 PYGO2Q9BRQ0 406 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 GGTLC1Q9BX51 225 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 SUCNR1Q9BXA5 334 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 OR52D1Q9H346 318 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 OR12D3Q9UGF7 316 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 CACNG2Q9Y698 323 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1B0GVX0 72 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1B0GXF2 115 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM210A6NLX4 147 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 CEACAM18A8MTB9 384 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 F5H768 121 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 H0Y980 276 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 CCRL2O00421 344 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 UPK2O00526 184 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 PHYHO14832 338 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 UGT2B7P16662 529 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 TGM4P49221 684 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 GRB2P62993 217 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 GNA13Q14344 377 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 SMUG1Q53HV7 270 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 CASP12Q6UXS9 341 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 WDFY1Q8IWB7 410 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 Q8N976 141 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 LINC01555Q8NAE3 123 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 OR4M2Q8NGB6 313 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 COQ8AQ8NI60 647 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 FMC1Q96HJ9 113 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 C18orf15Q96N68 181 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC17A9Q9BYT1 436 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 TPK1Q9H3S4 243 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A0U1RQV1 116 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 I3L4J1 428 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 M0QZ92 97 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 GPR171O14626 319 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 CHST10O43529 356 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 CTDNEP1O95476 244 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 APOEP02649 317 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 ATF1P18846 271 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 CELP19835 753 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 IL3RAP26951 378 aa4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms