RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	ARL6IP1	Q15041	203 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF79	Q15937	498 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	BIVM	Q86UB2	503 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529		Q8IYB0	196 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM104	Q8NE00	496 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	BORCS5	Q969J3	196 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	SRR	Q9GZT4	340 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	10.82	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	FZR1	Q9UM11	496 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	C17orf100	A8MU93	164 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	CA11	O75493	328 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	MGMT	P16455	207 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	CDK2	P24941	298 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	PTH2R	P49190	550 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF81	P51508	661 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	PLA2G7	Q13093	441 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	RSU1	Q15404	277 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	VHLL	Q6RSH7	139 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529		Q8TCH9	128 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	ABHD1	Q96SE0	405 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	GAL3ST1	Q99999	423 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	SYT3	Q9BQG1	590 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	IFT22	Q9H7X7	185 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	MSL2	Q9HCI7	577 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	HSF4	Q9ULV5	492 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	CACNA1D	Q01668	2161 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529		A6NNC1	897 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	SULT1C2	O00338	296 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	PLAU	P00749	431 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	IGHV1-46	P01743	117 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	GLA	P06280	429 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	SFTPB	P07988	381 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	PGA5	P0DJD9	388 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	TNFSF4	P23510	183 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	CPT2	P23786	658 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM50B	P56557	158 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	FGF12	P61328	243 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	HACD4	Q5VWC8	232 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	OR10K2	Q6IF99	312 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	LINC00596	Q86U02	117 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM46B	Q96A09	425 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	RFT1	Q96AA3	541 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	PHF21A	Q96BD5	680 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529		Q96M66	194 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	HES4	Q9HCC6	221 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	RASL12	Q9NYN1	266 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	HCFC1	P51610	2035 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529		F5H5P2	479 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	IFNL4	K9M1U5	179 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529		M0R233	179 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	CDIPT	O14735	213 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	ANGPTL7	O43827	346 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	MPIG6B	O95866	241 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	LHB	P01229	141 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	TNFRSF1A	P19438	455 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	IL18	Q14116	193 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	IL13RA2	Q14627	380 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	DTX2	Q86UW9	622 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	OSR2	Q8N2R0	312 aa		10.79	□□□□□ -0.68

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