RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465627.5

UBA3-208, Transcript of ubiquitin like modifier activating enzyme 3, human

TSL 2

Gene UBA3, Length 1,388 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBA3-208	ENST00000465627	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		7.48	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		7.48	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		7.48	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		7.48	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	FTMT	Q8N4E7	242 aa		7.48	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		7.48	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		7.48	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		7.48	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	BORCS8	Q96FH0	119 aa		7.48	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	CEP19	Q96LK0	163 aa		7.48	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	TM2D1	Q9BX74	207 aa		7.48	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		7.48	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	DLL4	Q9NR61	685 aa		7.48	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	RAB22A	Q9UL26	194 aa		7.48	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		7.48	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	FAM25A	B3EWG3	89 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	FAM25C	B3EWG5	89 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	FAM25G	B3EWG6	89 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	ZNF732	B4DXR9	585 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627		H0YL77	283 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	ABCD4	O14678	606 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	MAGEB3	O15480	346 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	LANCL1	O43813	399 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	ANGPTL7	O43827	346 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	CDC14B	O60729	498 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	CLDN14	O95500	239 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	MELTF	P08582	738 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	IL7	P13232	177 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	FABP6	P51161	128 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	GPM6A	P51674	278 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	ATP1B3	P54709	279 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	TMEM50B	P56557	158 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	TAS2R20	P59543	309 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	ERVK11-1	P61568	191 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	GNG3	P63215	75 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	MAB21L1	Q13394	359 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	ADIPOQ	Q15848	244 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	ELP2	Q6IA86	826 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	DTX3	Q8N9I9	347 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	LINC01560	Q8TB33	94 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	YIPF5	Q969M3	257 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	CYYR1	Q96J86	154 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627		Q96M66	194 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	PKIB	Q9C010	78 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	NEK6	Q9HC98	313 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	CA10	Q9NS85	328 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	FZR1	Q9UM11	496 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	ISPD	A4D126	451 aa		7.46	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	FAM221A	A4D161	298 aa		7.46	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		7.46	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627		E7EQL1	145 aa		7.46	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627		F8VVB4	439 aa		7.46	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627		F8VWA3	439 aa		7.46	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	SFTPB	P07988	381 aa		7.46	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	ADH4	P08319	380 aa		7.46	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	CD33	P20138	364 aa		7.46	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	RANBP1	P43487	201 aa		7.46	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	NPBWR2	P48146	333 aa		7.46	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	DGCR2	P98153	550 aa		7.46	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	TNP2	Q05952	138 aa		7.46	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	IL24	Q13007	206 aa		7.46	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	ZNF154	Q13106	437 aa		7.46	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	MADCAM1	Q13477	382 aa		7.46	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		7.46	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		7.46	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		7.46	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		7.46	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		7.46	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	ZNF611	Q8N823	705 aa		7.46	□□□□□ -1.21
UBA3-208	ENST00000465627	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.21

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