RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438356.1

RBM33-208, Transcript of RNA binding motif protein 33, human

TSL 4

Gene RBM33, Length 547 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM33-208	ENST00000438356	PPP3R1	P63098	170 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	IL24	Q13007	206 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	CDK5R1	Q15078	307 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	STUM	Q69YW2	141 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	MKX	Q8IYA7	352 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356		Q8IYB0	196 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	SEH1L	Q96EE3	360 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	OPALIN	Q96PE5	141 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	ZNF649	Q9BS31	505 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356		Q9H521	79 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	CKLF	Q9UBR5	152 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	GLS2	Q9UI32	602 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	PGA5	P0DJD9	388 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	RAB3A	P20336	220 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	EPHA1	P21709	976 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	MYF6	P23409	242 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	MPZ	P25189	248 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	SOX2	P48431	317 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	PAX8	Q06710	450 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	SMIM19	Q96E16	107 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	CEP19	Q96LK0	163 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	MND1	Q9BWT6	205 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	DYSF	O75923	2080 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	SIGLEC5	O15389	551 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	SULT1B1	O43704	296 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	INMT	O95050	263 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	MT-ND2	P03891	347 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	CDK1	P06493	297 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	PSG2	P11465	335 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	PRDX2	P32119	198 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	WNT4	P56705	351 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	CALHM1	Q8IU99	346 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	GHSR	Q92847	366 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	TMEM106A	Q96A25	262 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	SLAMF9	Q96A28	289 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	CNBD2	Q96M20	576 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	ZNF488	Q96MN9	340 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	GPER1	Q99527	375 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	RAB26	Q9ULW5	256 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356		A0A1W2PPH5	198 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356		A0A1W2PQ09	198 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	ZNF879	B4DU55	563 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	C22orf46	C9J442	243 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	OGG1	O15527	345 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	ALX3	O95076	343 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	KNG1	P01042	644 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	FGF12	P61328	243 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	BLMH	Q13867	455 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	GPR157	Q5UAW9	335 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	BATF2	Q8N1L9	274 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	ZNF561	Q8N587	486 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM33-208	ENST00000438356	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81

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