RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 PYHIN1Q6K0P9 492 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 NIPAL3Q6P499 406 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 ULK3Q6PHR2 472 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 SMARCD3Q6STE5 483 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 FAM131AQ6UXB0 335 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRK-211ENST00000429595 PPIAL4EA0A075B759 164 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRK-211ENST00000429595 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1W2PQ09 198 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 OR6C65A6NJZ3 312 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 PPIAL4DF5H284 164 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRK-211ENST00000429595 TXNDC12O95881 172 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 IGHV2-5P01817 119 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRK-211ENST00000429595 ACTG2P63267 376 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRK-211ENST00000429595 NAAAQ02083 359 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF154Q13106 437 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRK-211ENST00000429595 YIPF5Q969M3 257 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRK-211ENST00000429595 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
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PTPRK-211ENST00000429595 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 SLC7A7Q9UM01 511 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 POMT1Q9Y6A1 747 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRK-211ENST00000429595 CMYA5Q8N3K9 4069 aa5.12□□□□□ -1.59
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