RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428892.1

APOBEC3C-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3C, Length 1,056 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-202ENST00000428892 EGFL6Q8IUX8 553 aa9.02□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 C11orf53Q8IXP5 236 aa9.02□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 ELMOD2Q8IZ81 293 aa9.02□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 KIR3DL3Q8N743 410 aa9.02□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR51E1Q8TCB6 317 aa9.02□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa9.02□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 WFDC12Q8WWY7 111 aa9.02□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 TBX5Q99593 518 aa9.02□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa9.02□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 TLNRD1Q9H1K6 362 aa9.02□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM165Q9HC07 324 aa9.02□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 GPR84Q9NQS5 396 aa9.02□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 NDUFB11Q9NX14 153 aa9.02□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 MMP24Q9Y5R2 645 aa9.02□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 MPC1Q9Y5U8 109 aa9.02□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 METTL15A6NJ78 407 aa9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 LRRC30A6NM36 301 aa9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 A8MXK9 166 aa9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 J3QLW9 94 aa9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 LHBP01229 141 aa9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRT8P05787 483 aa9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 RPS2P15880 293 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF19P17023 458 aa9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 CCL1P22362 96 aa9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 MDH2P40926 338 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 GNB2P62879 340 aa9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRDX4Q13162 271 aa9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 SPCS2Q15005 226 aa9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRAM1Q15629 374 aa9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF404Q494X3 552 aa9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 CDONQ4KMG0 1287 aa9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAM76BQ5HYJ3 339 aa9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAM201AQ5SY85 155 aa9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 OLFML2AQ68BL7 652 aa9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAM220AQ7Z4H9 259 aa9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 CATSPERDQ86XM0 798 aa9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 SYS1Q8N2H4 156 aa9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 FTMTQ8N4E7 242 aa9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 GCSAMQ8N6F7 178 aa9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 HPSE2Q8WWQ2 592 aa9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR5P3Q8WZ94 311 aa9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF649Q9BS31 505 aa9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR51E2Q9H255 320 aa9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 DCSTAMPQ9H295 470 aa9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 UFSP2Q9NUQ7 469 aa9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR52A1Q9UKL2 312 aa9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 V9GYS6 101 aa9.01□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAM181BA6NEQ2 426 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 CEACAM18A8MTB9 384 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 DHRS3O75911 302 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 CLPXO76031 633 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF205O95201 554 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 WNT2P09544 360 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 CELP19835 753 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 CPT2P23786 658 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 CFHR2P36980 270 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 MAP2K3P46734 347 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 NCS1P62166 190 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 MZT1Q08AG7 82 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 SSX1Q16384 188 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 BCL2L15Q5TBC7 163 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZBTB37Q5TC79 503 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM42Q69YG0 159 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 FDX2Q6P4F2 183 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF826PQ6ZT77 177 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 C9orf139Q6ZV77 190 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 C1orf87Q8N0U7 546 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRSS35Q8N3Z0 413 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR1M1Q8NGA1 313 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR11L1Q8NGX0 322 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR14K1Q8NGZ2 314 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR8S1Q8NH09 359 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 ANAPC16Q96DE5 110 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 C4orf36Q96KX1 117 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM246Q9BRR3 403 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 FN3KRPQ9HA64 309 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 ABCB9Q9NP78 766 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 ACOXLQ9NUZ1 547 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 C14orf119Q9NWQ9 140 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 C1orf123Q9NWV4 160 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 RNF7Q9UBF6 113 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC22A13Q9Y226 551 aa9□□□□□ -0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 DHRS7CA6NNS2 312 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms