RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 PER3P56645 1201 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 TGFBR3Q03167 851 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 PDZK1IP1Q13113 114 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 PRDX4Q13162 271 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 TESK1Q15569 626 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 SPATA46Q5T0L3 261 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 VWA1Q6PCB0 445 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 TFAP2EQ6VUC0 442 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC25A26Q70HW3 274 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 FBXL14Q8N1E6 418 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 SPICQ8N5J4 248 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 C9orf106Q8NAJ2 232 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC30A7Q8NEW0 376 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 OR2AK2Q8NG84 335 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC107Q8WV48 283 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 Q96M66 194 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 FAAP24Q9BTP7 215 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 TM2D1Q9BX74 207 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 GLRX2Q9NS18 164 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 CRIM1Q9NZV1 1036 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 VSIG4Q9Y279 399 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 APC2O95996 2303 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 ACACAQ13085 2346 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 OR2AT4A6NND4 320 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 CD300LBA8K4G0 201 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 K7EM74 188 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 GOSR2O14653 212 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 TPOP07202 933 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 CELA3BP08861 270 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 GSTT2P0CG29 244 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 AKR1C4P17516 323 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHV1-2P23083 117 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 WNT5AP41221 380 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 HAAOP46952 286 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 NPBWR2P48146 333 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 GPM6AP51674 278 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 SNU13P55769 128 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 FOXF2Q12947 444 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 PIGYQ3MUY2 71 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 SIGIRRQ6IA17 410 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 OR2T2Q6IF00 324 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 OSR2Q8N2R0 312 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF611Q8N823 705 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 OR5H2Q8NGV7 314 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 MARCH1Q8TCQ1 289 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 ST8SIA4Q92187 359 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 WBP1Q96G27 269 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 PIPOXQ9P0Z9 390 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 ST3GAL6Q9Y274 331 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 NPTNQ9Y639 398 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM221AA4D161 298 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 SERPINE3A8MV23 424 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF732B4DXR9 585 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 RGS13O14921 159 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC22A5O76082 557 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 FOSL1P15407 271 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 SSTR2P30874 369 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 CBX5P45973 191 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 NPY4RP50391 375 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 DHRS2Q13268 280 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 ARL6IP1Q15041 203 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 LIN54Q6MZP7 749 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 HOGA1Q86XE5 327 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 C9orf62Q8N4C0 152 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 FTMTQ8N4E7 242 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 PXT1Q8NFP0 134 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 DYRK2Q92630 601 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 MRGPRFQ96AM1 343 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC120Q96HB5 630 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 SLA2Q9H6Q3 261 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC2A8Q9NY64 477 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 EHFQ9NZC4 300 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 AGFG2O95081 481 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 GIPP09681 153 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms